马耳他布鲁菌淄博分离株遗传进化分析及iELISA检测方法的建立

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:fang19902009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
布鲁菌病由布鲁菌引起,主要导致感染动物流产、不孕、关节炎等症状。它是世界上最严重的人畜共患传染病之一。其检测方法各有弊端。本试验针对新分离的菌株进行全基因组测序,用生物信息学软件对菌株基因的同源性和BvrS蛋白的抗原性进行预测分析,并利用此蛋白构建表达载体,以表达纯化后的蛋白作为抗原建立间接ELISA检测方法。目的在于建立一个高准确率的布鲁菌临床初筛检测方法。首先对布鲁菌淄博地方分离株进行全基因组高通量测序。利用16S RNA进行多序列比对分析确定该菌株为布鲁菌。将菌株全基因组与近缘菌株基因序列进行比对,并构建系统发育树,发现该菌株为马耳他布鲁菌。该菌株虽然与多株马耳他布鲁菌有极高的同源性,但全基因组与其他已知菌株基因组均不完全相同。其次,利用生物信息学软件对BvrS蛋白的理化性质、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位、跨膜结构域等进行预测。共预测到23个抗原决定簇预测,13个B细胞线性抗原表位,多个T细胞抗原表位。结果发现BvrS蛋白具有较好的抗原性,可做为间接ELISA检测方法的抗原。使用TMNMM对于BvrS蛋白进行预测,发现该蛋白具有两次跨膜,跨膜域疏水性较高,对蛋白表达影响较大,故选择胞外域311-601aa进行基因扩增及p ET-28a(+)-BvrS表达载体的构建。构建好的表达载体表达蛋白的最终浓度为1.78 mg/m L。将制备的蛋白作为抗原,建立i ELISA检测方法,并对各参数进行了优化。优化结果表明,包被蛋白最佳浓度为1μg/m L,最佳血清稀释度为1:25,驴抗山羊Ig G-HRP最佳稀释度为1:2000,最佳封闭为5%BSA。使用新建立的i ELISA(BvrS)检测方法对山东省16个地市共计800份随机样品进行检测,并与其他检测方法进行比较,结果显示与虎红平板凝集试验阳性符合率为83.87%、与试管凝集试验阳性符合率为80.77%、与c ELISA阳性符合率为88.46%。建立的i ELISA(BvrS)检测方法准确性高,可用于大量样本的羊布鲁菌临床初筛。综上所述,经全基因组测序分析发现此菌株为马耳他布鲁菌,通过对其BvrS蛋白的生物信息学预测分析,发现此蛋白具有良好的抗原性。以表达纯化的BvrS蛋白作为包被抗原,构建了i ELISA(BvrS)布鲁菌病检测方法,准确率高,可用于羊布鲁菌的临床初筛。
其他文献
禽网状内皮组织增生症(Reticuloendotheliosis,RE)是由禽网状内皮组织增生症病毒(Reticuloendotheliosis virus,REV)引起禽类的一种以淋巴组织及其他组织出现慢性肿瘤为特征的病理综合征。低日龄雏鸡感染REV后常引起严重的免疫抑制,再免疫其他禽用疫苗时,导致疫苗免疫失败。REV可通过种蛋垂直传播,是种源需要净化的病毒之一,同时携带REV的SPF鸡胚用于生
学位
汞是一种广泛分布且难降解的重金属污染物。日益加剧的汞污染使得人和动物都面临很高的汞暴露风险,对人和动物的健康构成严重威胁。尽管已有针对人急性汞中毒的治疗方案,但在养殖业中的可实施性不强,因此更多安全、有效、毒副作用小和成本低的防治方法应该被探索。肝脏是体内最重要的代谢和解毒器官,这使得肝脏成为汞毒性的主要靶器官之一。硒和汞具有独特的物理亲和力,可以结合形成稳定无毒的汞-硒化合物。更重要的是,硒作为
学位
星状病毒(Astrovirus,Ast V)是一种单股正链RNA病毒,是能够引起人及其他多种动物腹泻疾病的人兽共患病病原。该病毒具有基因高度变异和遗传变异性,容易发生基因重组,使其具有不断适应新宿主和跨种间的传播能力。猪星状病毒(Porcine astrovirus,PAst V)在猪群中存在较高的流行率,且易与其他腹泻病毒,如冠状病毒、轮状病毒等混合感染,给猪场造成严重的损失。因此,本研究将对山
学位
防御素是富含半胱氨酸的阳离子肽,在消化系统,呼吸系统,免疫系统和生殖系统中均有分布,并在这些系统中起到抗菌、抗病毒和抗肿瘤等作用。防御素在无脊椎动物和脊椎动物的先天免疫系统中起着重要作用。本研究建立一种荧光定量PCR检测β-防御素7(AVBD7)的方法,通过使用此方法检测鸭AVBD7在健康鸭组织中的分布以及感染禽致病性大肠杆菌(APEC)和产气荚膜梭菌(CP)后鸭AVBD7的表达变化情况。成功构建
学位
牛乳腺炎是奶牛养殖业中常见的一种危害奶牛健康,影响奶牛生产的重要疾病。金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)是奶牛乳腺炎的主要病原菌之一,可入侵牛乳腺上皮细胞导致乳腺持续感染,并容易产生耐药性。氢疗法是近几十年来逐渐兴起的一门治疗技术,氢气分子量小易扩散,代谢产物无毒,有很明显的抗氧化作用,在动脉粥样硬化、神经退行性病变、缺血再灌注等疾病进行了广泛研究。近年
学位
目的 探讨核因子-κB(NF-κB)和表皮生长因子受体(EGFR)在胃癌组织中的表达及其临床病理意义。方法 采用免疫组织化学方法(SP法)对比分析106例胃癌组织和相应的正常胃黏膜组织中NF-κB、EGFR的表达情况,研究二者在胃癌中表达的相关性,探讨其与临床病理特征的关系。结果 NF-κB蛋白在胃癌组织阳性表达率为67.9%,明显高于相应正常胃黏膜组织(5.9%,P<0.05)。胃癌组织和正常黏
期刊
我国是世界上最大的肉鸭生产国,鸭肉产量约占世界鸭肉总产量的69.2%。近年来,多种水禽传统病毒如鸭瘟病毒、鸭病毒性肝炎病毒感染鸭群发病以及鸭坦布苏病毒和新型鸭呼肠孤病毒等新型病毒在临床上的流行,给我国养鸭业带来严重的经济损失。传统的防治病毒的方法以疫苗防疫和抗病毒药物治疗为主,但二者往往具有特异性,无法做到广谱抗病毒。而宿主的先天性免疫反应,通过模式识别受体感知病原体相关分子模式,启动下游信号传导
学位
随着生态环境的恶化,土壤盐碱化问题日益严峻,严重制约了现代农业的发展。选育耐盐碱植物,探究植物耐盐碱机制,是改良盐碱地的有效途径。为探讨盐碱胁迫下盐肤木的生理响应,选育耐盐碱优良家系,本试验以5个盐肤木家系T1、T2、T3、CL、M为试验材料,采用营养液培养的方法,模拟不同浓度盐碱胁迫(0、50、100、150 mmol·L-1 Na Cl:Na HCO3=1:1)处理,测定分析盐肤木叶片相对含水
学位
干旱具有发生频率高、强度大及持续时间长等特点,严重影响到植物的生长发育。研究植物抗旱机理,提高植物的抗旱能力对提高农林业生产具有重大意义。杨树的根系发达,生长健壮,枝叶茂密,叶色叶形也具有特点,是行道树的优良品种,在美化城市、园林建设和街道绿化中具有重大的意义,同时还具有净化空气,减音降尘等生态功能。本研究以过表达PeMPK7杨树的两个独立转基因株系OE 3-3(低水平表达)和OE 1-6(高水平
学位
干旱已成为全球日益严重的问题,是影响植物生长发育的主要非生物胁迫因素之一。阐明植物的抗旱机制、提高植物的抗旱能力对于杨树的耐旱育种及应用具有重要意义。杨树是我国重要的防护树种和园林绿化树种,在道路绿化、公园和风景区绿化、滨水绿化等园林绿化方面具有重要价值,在我国被广泛应用。为探讨杨树在干旱胁迫下的耐旱机制,本研究选取两个PeMPK15过量表达水平不同的转基因株系OE-2(较高)和OE-3(较低)以
学位