孵化温度对鸭胚基因组甲基化的时空影响及相关基因的转录调控研究

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孵化温度作为禽类胚胎发育的重要外源环境因素之一,适当改变能影响禽类胚胎及出壳后骨骼肌发育。我们猜测基因组表观遗传机制在其中起了重要作用,即孵化温度改变可能影响鸭胚基因组甲基化程度,进而影响基因表达水平,并最终导致鸭个体表型性状的改变。因此,本研究拟扩增鸭DNA甲基转移酶(DNMTS)和甲基结合蛋白(MBPS)基因家族基因cDNA部分序列,设计特异性荧光定量引物,研究孵化温度对甲基化相关基因表达的时空影响;在此基础上,从骨骼肌发育相关基因中筛选部分表达水平受孵化温度影响明显的基因,分析其启动子甲基化状态及表观修饰对基因转录调控的可能影响,从表观遗传角度探讨孵化温度影响禽类胚胎发育及成年表型的可能机制。主要研究结果如下:(1)克隆获得鸭DNMT1.DNMT3A,DNAMT3B,MBD3和MBD5基因cDNA部分序列,长度分别为507、481、443、387和525bp,与Genebank中原鸡的相应序列同源性达到91%~99%。(2)鸭胚腿肌、胸肌、心脏、肝脏和脾脏中均检测到DNMMT1.DNMT3A,DNMMT3B,MBD3和MBD5基因不同程度的表达,结果表明DNA甲基化参与组织形成,尤其在胸肌中高度表达,说明DNA甲基化可能在胸肌形成过程中具有特殊的意义。此外,检测到甲基化相关基因在脾脏中表达较高,表明DNA甲基化水平在细胞分裂旺盛的组织中相对较高。(3)孵化前期温度处理对DNMT1,DNMT3A和DNMT3B基因表达有显著影响(P<0.05),说明DNA甲基化水平在胚胎发育前期呈明显变化趋势;在整个孵化期内,MBD3和MBD5在处理组和对照组中基因的表达模式一致,表明孵化温度对甲基结合蛋白基因家族成员转录水平的影响一致。(4)孵化前期的温度处理可显著上调骨骼肌发育相关基因Pax3,Pax7,sixl, Akirin2,MyoD,MyoG,Mfy5,MCK和TNNCl的表达(P<0.05),而随着孵化时间的延长,温度处理则显著抑制Pax7,Six1,Akirin2,MyoD,MyoG和TNNCl基因的表达(P<0.05),说明孵化温度对骨骼肌发育相关基因表达调控的影响具有明显阶段性。(5)孵化前期和中期,处理组内TNNCl基因启动子CpG岛甲基化水平显著低于对照组(P<0.05);孵化前期,处理组内Akirin2基因启动子CpG岛甲基化水平显著低于对照组(P<0.05),说明孵化前期温度升高1℃,对基因启动子CpG岛的整体甲基化水平有抑制,但对基因表达水平有促进作用。
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