引入西门塔尔牛、利木赞牛、黑安格斯牛、红安格斯牛、金黄阿奎顿牛、劳莱恩牛、海福特牛、德国黄牛等8个肉用品种及肉乳兼用品种冻精或种公牛与本地黄牛(川南山地黄牛)杂交，通过对本地黄牛及其与引进品种的杂交后代初生、3、6、12、18、24月龄的生长发育性状的测定，研究不同杂交细合对本地黄牛的体尺体重改良效果，计算超亲优势。选用11个微卫星标记分析这8个引入品种以及川南山地黄牛的群体遗传结构和遗传变异；通过肉牛生长发育性状杂种优势与亲本遗传距离的关系，探索肉牛杂种优势的预测方法。研究结果如下：(1)在生长发育性状方面，杂种牛的体尺体重均高于川南山地黄牛。在整个测定期内体重增长速度较快的为海杂牛、西杂牛、红杂牛和德杂牛，体高总体增长较快的为海杂牛和西杂牛，体斜长总体增长较快的为西杂牛、海杂牛、红杂牛和德杂牛，体直长总体增长较快的为海杂牛和西杂牛，胸围和管围总体增长较快的是西杂牛、海杂牛和红杂牛。总的看来，用海福特牛、西门塔尔牛和红安格斯牛改良川南山地黄牛体尺体重效果较好。(2)11个微卫星位点在9个群体中共检测到80个等位基因，每个位点平均为7.27个等位基因，每个位点平均有效等位基因数为3.0069～4.9912，每个位点平均多态信息含量为0.3566～0.4098，各位点平均杂合度为0.6854～0.7918，各群体平均杂合度为0.6591～0.8413。(3)川南山地黄牛遗传一致性低，11个微卫星位点的平均杂合度为0.8413。(4)根据11个微卫星位点在9个种群中的等位基因频率，计算种群之间的标准遗传距离。川南山地黄牛与引进品种的遗传距离大小依次是：黑安格斯牛、利木赞牛、海福特牛、劳莱恩牛、红安格斯牛、西门塔尔牛、德国黄牛和金黄阿奎顿牛，分别为0.5068、0.3257、0.2910、0.2409、0.2082、0.1500、0.1447和0.1009。并且对部分群体进行聚类：西门塔尔牛与德国黄牛聚为一类，再与本地黄牛聚为第二类，然后与红安格斯牛、利木赞牛聚为第三和第四类，最后与黑安格斯牛聚在一起。(5)采用Spearman等级相关分析微卫星遗传距离与杂种优势的关系，结果r_s=0.16071(P＞0.05)，等级相关不显著。(6)采用分子数量遗传学综合评定方法对各杂交组合优劣进行评估，三峡库区肉牛杂交组合优劣的排序(以父本为代表)为：海福特牛、红安格斯牛、西门塔尔牛、金黄阿奎顿牛、黑安格斯牛、利木赞牛、德国黄牛和劳莱恩牛。