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目的 探究人类免疫缺陷病毒(human immunodificiency virus,HIV)感染者和健康者之间肠道菌群的差异以及联合抗反转录病毒治疗(combined antiretroviral therapy,cART)对艾滋病毒感染者肠道微生物群的影响。方法 1.研究对象为2018年至2019年在杭州市西溪医院住院的53例艾滋病毒感染者以及6名健康志愿者,并搜集研究对象的多项实验室指标和临床资料,将其分为未感染HIV的对照组(Control组)、未治疗的HIV感染者组(Untreated组)、经过cART且血病毒载量阳性的HIV感染者组(cART1组)和经过cART且血病毒载量阴性的HIV感染者组(cART2 组)。对 Control 组与 Untreated 组、Untreated 组与 cART1 组、cART1组与cART2组进行比较分析。2.收集研究对象的粪便标本,并提取粪便标本的总DNA,总DNA经过检测、PCR扩增、产物纯化、文库制备和质检等实验步骤,最后应用Illumina MiSeq平台对DNA片段进行测序。3.对测序原始数据进行处理,对处理过后的数据进行生物信息学分析和统计学分析。结果 1.有效数据长度分布,<200bp有18887条,占1.31%,200-300bp有12690条,占 0.88%,300-400bp 有 157891 条,占 10.98%,400-500bp 有 1247897 条,占 86.82%,≥500bp 有 2 条,占 0.01%2.操作分类单元分析,Control组与Untreated组有662个共有OTU,前者特有162个OTU,后者特有989个OTU;Untreated组与cART1组有1215个共有OTU,前者特有436个OTU,后者特有245个OTU;cART1组与cART2组有1099个共有OTU,前者特有361个OTU,后者特有327个OTU。3.Alpha多样性分析,总体呈现Control组>Untreated组>cART2组>cART1组,各比较组间无显著性差异。4.Beta多样性分析,Control组与Untreated组之间区分的较开,Control组与Untreated组之间有较明显的差异,但Untreated组也有距离Control组较近的点存在。Untreated组和cART1组与cART1组和cART2组两比较之间无显著性差异。5.物种分析,门水平主要有4个,分别为厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门和放线菌门,它们的含量达95%以上。Control组拟杆菌门(52.30%)>厚壁菌门(42.39%)>变形菌门(3.89%)>放线菌门(0.71%),Untreated组厚壁菌门(54.89%)>拟杆菌门(23.06%)>变形菌门(11.89%)>放线菌门(8.53%),cART1组和cART2组变形菌门(40.01%和39.58%)>厚壁菌门(37.21%和 31.19%)>拟杆菌门(16.45%和 24.94%)>放线菌门(5.35%和3.49%)。观察属水平发现Control组含量超过5%的属为拟杆菌属(37.15%)、普雷沃菌属(10.61%)和巨单胞菌属(10.56%),Untreated组含量超过5%的属为埃希菌属(10.39%)、拟杆菌属(6.04%)、普雷沃菌属(9.72%)、肠杆菌科未分类菌属(13.78%)和副拟杆菌属(6.43%),cART1组超过5%的属为埃希菌属(26.68%)、拟杆菌属(6.30%)、普雷沃菌属(9.04%)、肠杆菌科未分类菌属(11.84%)和克雷伯菌属(9.13%),cART2组超过5%的属为埃希菌属(35.47%)、拟杆菌属(9.83%)和普雷沃菌属(10.72%)。LEfSe分析发现Control组与Untreated组比较,Untreated组芽孢杆菌纲、放线菌目和假单胞菌目中的细菌含量较高,Control组拟杆菌门,疣微菌门、β-变形菌纲、Negativicutes、梭菌目、毛螺菌科、韦荣球菌科,嗜胆菌属和爱格士菌属中的细菌含量较高;Untreated组与cART1组比较,Untreated组厚壁菌门未分类菌纲、鞘脂杆菌纲、放线菌目、口腔杆菌属、消化链球菌属和颤杆菌属中的细菌含量较高,cART1组的变形菌门中的细菌含量较高;cART1组与cART2组比较,cART1组葡萄球菌科和瘤胃菌科未分类菌属中的细菌含量较高,cART2组糖化细菌门中的细菌含量较高。结论 1.HIV的感染导致肠道菌群物种多样性的降低,并与健康人的肠道菌群比较出现显著性差异,物种组成变化较大。2.经过cART治疗但血病毒载量阳性的HIV感染者肠道菌群并未向健康方向发展,反而进一步趋于紊乱,cART治疗在一定程度上对肠道菌群产生了消极影响,使其多样性进一步下降。3.经过cART治疗且血病毒载量转阴的HIV感染者组肠道菌群物种多样性小幅提升,但依旧处于不健康状态,其与经过cART治疗但血病毒载量阳性的HIV感染者较为相似,治疗结局的不同对肠道菌群的影响不明显。