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本研究利用绵羊基因组中第3条染色体上的11个微卫星(Microsatellite)标记，采用父系半同胞家系群体对控制凉山半细毛羊毛性状的数量性状座位(QTL)进行研究。性状的表型值包括育成毛纤维直径(WFD1)、成年毛纤维直径(WFD2)、断乳毛长(SL1)、育成毛长(SL2)和成年毛长(SL3)均来自此群体的鉴定记录及实验室测定。群体在这11个微卫星标记座位上的等位基因频率、微卫星的多态信息含量(PIC)、群体的杂合度(Heterozygosity)以及毛性状QTL进行了分析。 群体性状表型值分析结果显示：WFD1为32.15±2.16μm；WFD2为35.02±2.61μm；SL1为6.49±2.29cm；SL2为14.04±1.69cm；SL3为16.15±1.84cm。分析结果与以前研究结果一致，说明整体水平上基本达到了使性状趋于一致的育种目标。各家系的毛性状表型值分析结果表明，各家系间存在差异，但差异不大。家系内表现有所不同，这正是利用父系半同胞家系进行QTL定位的基础。 所选择的11个微卫星标记在凉山半细毛羊群体中表现出较好的多态性。微卫星标记平均检测到7.8个等位基因(5～11个)，平均多态信息含量(PIC)为0.6038(0.3125～0.8410)，平均杂合度为0.6423(0.3232～0.8179)。微卫星的多态性和Genbank中的结果存在差异，其原因可能是试验群体和群体大小的差异引起的。 用覆盖3号染色体上的11个微卫星标记(标记区间平均为29.3cM)对绵羊7个家系的5个毛性状进行QTL检测。MultiQTL程序的分析结果显示：在家系H1G4003中，断乳毛长(SL1)和成年毛长(SL3)在99％置信区间时均表明在RM150-ILSTS22(66.3～90.0cM)标记区间有显著的QTL；在家系H1G4035中存在一连续显著的QTLs，有两个分离的峰，一个位于标记BMS1953(204cM)处，另一个位于BMC1009-OARCP43(229.4～253.5cM)标记之间，BMC1009与QTL的重组率为8.6％。本次试验结果显示BMC1009标记与影响毛长的QTL存在连锁，这与已报道的结果(Allain，D.et al.,1996)相一致。所有家系中没有检测到育成毛纤维直径，成年毛纤维直径显著的QTL，也没有发现育成毛长存在显著的QTL，可能是因为资源参考家系少，家系小和标记密度小等原因，也可能是毛纤维直径QTL与羊毛长度QTL在3号染色体上没有相关性存在。 通过文献检索，未发现绵羊第3条染色体RM150-ILSTS022记区间有影响羊毛长度的QTL的报道，我们将通过增加样本量和缩小标记区间的方法进一步加以验证。