免疫系统是机体执行免疫应答及免疫功能的重要系统,机体内很多蛋白受外界刺激后,会激活免疫系统。TRIM家族和USP家族蛋白在生命的多个过程中发挥着重要作用。三结构域蛋白（Tripartite motif Protein,TRIM）是一种结构保守的蛋白,在许多生物过程中发挥重要作用,例如细胞凋亡、细胞周期调节、细胞对病毒的应答和炎症反应等。本研究选用免疫器官脾脏及TRIM47鲤鱼中高表达组织脑作为实验材料,通过对敲除TRIM47斑马鱼的脑和脾进行转录组学分析,阐明TRIM47在斑马鱼中可能发挥的作用,以及研究USP5蛋白在天然免疫中发挥的作用及其机制探讨。为进一步了解硬骨鱼类的天然免疫提供一定的理论基础。主要内容如下:1. 敲除TRIM47斑马鱼脑和脾的转录组学分析本研究采用CRISPR/Cas9技术敲除了斑马鱼的TRIM47基因,收集TRIM47^-/-（TRIM47敲除）和WT（野生型）斑马鱼的脑和脾脏进行RNA-seq分析,鉴定差异表达基因（Difference Expression Genes,DEGs）。在这项研究中与野生型斑马鱼相比在敲除组鉴定出271个脑和脾脏中的DEGs。对这些DEGs进行简要分析之后,将这些DEGs注释为KEGG途径以及经过GO富集分析。与WT组相比,TRIM47^-/-组在脑中的DEGs集中在细胞粘附和谷氨酸能突触信号传导途径中;在脾脏中,与野生型组相比,TRIM47^-/-组的DEGs在补体和凝血级联信号通路中发生了变化。用q RT-PCR验证了脑和脾中与补体途径相关的基因,与转录组数据一致。这些结果表明,TRIM47在起着重要的生物学作用,特别是通过补体途径参与先天免疫功能。对敲除TRIM47和野生型斑马鱼进行了SVCV感染实验,敲除TRIM47组的斑马鱼存活率更低。这些发现为进一步研究TRIM成员在先天免疫中的功能提供了基础。2. USP5抗病毒研究泛素特异性蛋白酶（Ubiquitin-Specific Protease,USP）家族参与许多生命过程,其中抗病毒是重要的功能之一,而激活干扰素是一种重要的抗病毒方式。本研究旨在阐明斑马鱼泛素特异性蛋白酶5（USP5）的抗病毒机理。通过对USP5进行进化树和蛋白序列同源性分析,确定了USP5在FHM细胞中的定位。USP5的过表达能激活更高的IFNφ1和ISGs的m RNA水平,IFNφ1和IFN刺激的响应元件（ISRE）的启动子活性也同样被激活。研究发现USP5能够增强RIG-I的表达,Poly（I:C）处理后与空载体相比能刺激起更高水平的IFNφ1。病毒感染和干扰试验表明,USP5在体外抑制了SVCV的复制。本研究结果表明,USP5能够通过增加RIG-I蛋白水平来激活更高水平的干扰素,从而实现抗病毒功能,这也为鱼类抗病毒提供一定的理论研究。