一直以来高技术产业在国民经济发展过程中占据着技术创新的高地,对于国家创新能力的提升和经济发展的影响十分深远。我国高科技产业经过30多年的发展,从无到有、从弱到强,为我国国民经济的发展起到重要支撑推动作用。协同创新作为未来技术创新的方向,受到党和国家的高度重视。党的十八大工作报告中明确提出在诸多创新中,要尤其注重协同创新。这也为我国高科技产业未来创新活动的方向提供全新可行方向。本文借助于复合系统协同度模型,从技术创新过程模式出发科学划分我国高科技产业的协同创新系统,具体包括有创新资源子系统、创新成果子系统和辅助子系统。在此基础上通过收集整理2005年至2011年我国高科技产业创新发展的相关指标构成关键序变量,进一步测度出我国高科技产业内部五个子行业的协同创新程度,对高科技产业内部的协同创新程度进行结构分析。具体内容包括：第一章绪论部分,介绍研究背景、目的、意义、方法及框架结构等；第二章从协同学理论和技术创新理论出发构建本文理论基础,并界定协同创新概念,并综述国内外研究成果；第三章在对我国高技术产业界定基础上,指出高科技产业的主要特征、驱动因素,并从我国高科技产业现实发展情况出发,指出我国高科技产业协同创新发展的现实情况；第四章基于复合系统协同度模型,在对技术创新过程模式进行研究基础上划分高科技产业协同创新系统,并选择关键序变量构建指标体系；第五章通过关键序变量有序度、子系统有序度及整体协同度三个层次的实证分析结果,对高科技产业协同创新程度进行分析；第六章结合前部分研究内容从创新投入、创新产出和创新环境三个维度提出有针对性的政策建议；第七章结论与展望。研究结果表明：(1)我国高技术产业协同创新程度整体上呈现增长趋势,但是协同创新水平处于较低水平、产业内部五个子行业的协同创新程度具有较大差异；(2)创新资源子系统的有序度呈现整体增长趋势,但是资源投入过程中的无序性限制创新资源子系统有序度提高；(3)创新成果子系统的有序度呈现整体增长趋势,但是产学研价值链的脱节限制创新成果子系统有序度的提高；(4)辅助子系统有序度呈现波动增长趋势,且为影响我国高技术产业协同创新程度提高的关键因素,协同创新环境有待进一步改善。