【摘 要】
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蛋壳颜色作为家禽的重要经济性状,在家禽养殖业中受到广泛的关注。目前,鸡绿色蛋壳的遗传基础已经发现。然而,对于鸭而言,绿色蛋壳颜色的遗传机制并未发现。在这项研究中,我们利用高通量测序技术对莆田白鸭白色蛋壳,莆田黑鸭白色蛋壳和莆田黑鸭绿色蛋壳的蛋壳腺进行测序,寻找绿壳蛋颜色形成的miRNA。我们获得了 108471471个高质量的读取,并将它们映射到鸭基因组。总共获得了 152520个已知的miRNA
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蛋壳颜色作为家禽的重要经济性状,在家禽养殖业中受到广泛的关注。目前,鸡绿色蛋壳的遗传基础已经发现。然而,对于鸭而言,绿色蛋壳颜色的遗传机制并未发现。在这项研究中,我们利用高通量测序技术对莆田白鸭白色蛋壳,莆田黑鸭白色蛋壳和莆田黑鸭绿色蛋壳的蛋壳腺进行测序,寻找绿壳蛋颜色形成的miRNA。我们获得了 108471471个高质量的读取,并将它们映射到鸭基因组。总共获得了 152520个已知的miRNAs和1526个新的miRNAs。为进一步分析差异表达miRNAs的功能,对miRNA靶基因进行KEGG通路分析。经由白色蛋壳和绿色蛋壳的比较,我们发现,miRNA-186-x和miRNA-497-x 均差异显著（P<0.05）。VEGF,HMOX 基因,ATP2B 和 SCP2 分别在VEGF信号通路,卟啉和叶绿素通路、钙信号通路和过氧化物酶体上调。推测这几个基因可能是调节绿蛋壳的形成。本研究为鸭蛋壳腺组织中mRNA和miRNA调控提供了有价值的信息,所鉴定的差异表达基因将为鸭蛋壳颜色的进一步遗传分析提供有价值的资源。
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