肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是最常见的恶性肿瘤。利用使用化学诱导剂二乙基亚硝胺(DEN)建立的大鼠原发性肝癌模型研究肝细胞癌可能的发生机制。取大鼠肝癌及正常肝组织各取三个样品，分别从蛋白质组学和基因表达谱技术两方面分析样品。蛋白组学技术利用2D-DIGE和MALID-TOF-MS技术。基因表达谱使用安捷伦最新的大鼠44K基因组芯片进行分析。结果：蛋白质组学：利用2D-DIGE和MALID-TOF-MS蛋白组学技术我们分析了18个蛋白差异点，这些点可以对应到由DEN诱导的大鼠肝癌模型的差异表达蛋白中。在这些肿瘤相关蛋白中，明显上调的蛋白包括GST超家族，醛-酮还原酶超家族和缺氧应激相关蛋白的相应成员。下调的蛋白有延胡索酰乙酰乙酸酶，在肝癌中都有报道和3-氧-5-B类固醇-4乳酸脱氢酶，它的缺失可造成肝功能紊乱。另外，在大鼠肝癌组织发现dermcidin，一种汗腺特异性蛋白有明显上调。通过western和免疫组化进一步证明了蛋白组学的结论。相对应的样品通过aligent芯片分析。通过生物信息学进行聚类及功能分类分析结果显示，有789个基因显著上调，559个基因显著下调，这些显著变化的基因主要与细胞周期、细胞浸润及转移、细胞信号转导及细胞代谢等密切相关。这些基因可能是使用化学诱导剂产生的肝癌的标志物，在肿瘤的早期诊断、寻找药物作用靶点、预后判断、监测及个体化治疗中起重要作用。化学诱导剂产生的肝癌模型与人肝癌有着相似性，所以这些数据对研究肝细胞癌的机制有重要意义。我们的结果提示综合运用蛋白组学和基因组学技术有助于寻找肿瘤相关蛋白和理解肿瘤发生的相关机制。