自股转系统扩容以来，挂牌公司数量不断增加，新三板市场爆发式发展，在发展的同时，因挂牌门槛低导致的各类问题也不断暴露，挂牌企业业绩分化大、波动性大、市场流动性差，估值整体偏低，不仅如此，一些企业出现了信息披露、公司治理等方面的重大违规事项，这对证券公司做市商的风险管理是一个重大考验。股转系统做市商的风险管理机制完善与否，对其运行效率与做市商业务的长远发展起着重要作用，因此，从监管角度研究股转系统做市商风险管理，是迫切需要探讨的。　　本文运用案例分析方法，根据我国证券市场的运行特征和股转系统交易业务未来发展的需要，结合境外市场的经验，对我国证券公司股转系统的做市商交易机制在运行过程中可能存在的问题与风险点做了研究。论文认为，完善现有做市商制度可以有效防范做市商面临的风险，加强对做市商的风险管理，不仅能够规避做市商自身风险，提高盈利能力，更加有利于股转系统整体流动性的提高，促进股转市场的健康发展。论文提出提高做市证券质量、开发风险对冲工具、建立第三方担保等做市商风险管理的建议。