【摘 要】
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背景:白人,黑人,亚洲人前列腺癌(PCa)的药物敏感性和预后各不相同,但其最初始的机制仍然很少被了解。方法:1.485例PCa病人(包括415例白人、58例黑人和12例亚洲人)的转录组学、表观基因组和单核苷酸多态性(SNPs)数据以及临床信息自TCGA数据库获取。2.mRNA,miRNA,lncRNA,DNA甲基化表达差异性分析以及SNP差异性分析用来揭示各种族前列腺癌遗传背景差异。3.GSEA、
【基金项目】
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国家自然科学基金(NSFC 81602248);
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背景:白人,黑人,亚洲人前列腺癌(PCa)的药物敏感性和预后各不相同,但其最初始的机制仍然很少被了解。方法:1.485例PCa病人(包括415例白人、58例黑人和12例亚洲人)的转录组学、表观基因组和单核苷酸多态性(SNPs)数据以及临床信息自TCGA数据库获取。2.mRNA,miRNA,lncRNA,DNA甲基化表达差异性分析以及SNP差异性分析用来揭示各种族前列腺癌遗传背景差异。3.GSEA、DAVID和Webgestalt富集分析共同用来鉴定不同种族前列腺癌药物代谢及药物抵抗差异性通路。4.相关性分析以及靶向调控分析用来揭示各种族前列腺癌药物抵抗差异和药物代谢的关系。同时,药物代谢相关核心基因在靶向调控分析中被鉴定。5.CCLE,GDSC,CTRP数据用来验证药物代谢相关核心基因和前列腺癌细胞系药物敏感性之间的关系。同时,利用药物代谢相关核心基因建立各种族前列腺癌ROC预后模型。结果:1.白人,黑人,亚洲人前列腺癌转录组学、表观基因组和单核苷酸多态性(SNPs)存在显著差异。2.黑人和白人比亚洲人更容易富集在药物代谢、细胞毒治疗耐药和内分泌治疗耐药相关通路,而白人比黑人更容易富集在药物代谢、细胞毒治疗耐药和内分泌治疗耐药相关通路。3.各种族前列腺癌细胞毒治疗耐药、内分泌治疗耐药与药物代谢相关基因相关性良好,且存在靶向调控关系。4.药物代谢相关核心基因 CYP1A1、CYP3A4、CYP2B6、UGT2B17、UGT2B7、UGT1A8、UGT2B11、GAS5、SNHG6、XIST 对 PCa 细胞系抗肿瘤药物的敏感性有很大影响,并且这些基因对PCa患者的药物反应和治疗结果也有良好的预测效果。结论:白人、黑人和亚洲人前列腺癌患者的转录组学、表观基因组和单核苷酸多态性SNPs均存在显著差异,这直接导致了药物代谢、药物抵抗途径的差异。此外,药物代谢促进了不同种族的耐药差异,从而导致前列腺癌患者的药物反应和治疗结果的差异。因此,这些发现可以帮助我们了解不同种族前列腺癌患者药物代谢差异的机制,从而为各种族前列腺癌患者制定个体化治疗策略。
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