农作物秸秆作为第二代生物质燃料乙醇的原料，纤维素酶解率低一直是制约其商业运营的关键因素。为此本课题依照工业生产实际情况，对长期自然条件下储存的小麦秸秆蛋白进行研究，探讨蛋白对纤维素酶活力的影响，得出如下结果：1)经过长期在室温条件下的储存，小麦秸秆中蛋白含量仅剩约3.24%，很大一部分在储存过程中发生降解。分别采用SDS浸提缓冲液、NaOH浸提缓冲液、NaCl浸提缓冲液对这些蛋白进行了浸提，从提取率来看SDS浸提缓冲液能得到最大蛋白提取率。2)对SDS蛋白浸提液提取小麦秸秆的条件进行优化，通过单因素和正交试验研究，结果表明最佳提取条件为浸提时间12h，浸提温度50℃，固液比1:20，最大浸提率为21.76±0.01%，通过对浸提蛋白分子量的测定发现，浸提蛋白分子量分别约为18KD，22KD，32KD和40KD。3)研究去除蛋白后小麦秸秆纤维素酶水解的效果，蛋白去除方式为（a）蛋白浸提；（b）蛋白水解；（c）未处理。对蛋白酶水解秸秆蛋白条件进行研究发现，最佳条件为：蛋白酶用量100mg，固液比1:20，水解温度45℃，水解pH3.0，水解时间12h。对比三种方式处理后蛋白残余量，蛋白去除效果为：蛋白水解＞蛋白浸提＞未处理；对三种方式处理过的小麦秸秆粉末进行纤维素酶解条件优化，通过单因素试验和正交试验得到各自最大纤维素酶解率为：蛋白水解样品酶解率56.23%，蛋白提取样品酶解率49.17%，未处理样品酶解率35.01%，说明蛋白去除效果与纤维素酶解率正相关，该蛋白质对纤维素酶解过程存在抑制作用。4)提取出的蛋白自身不具备内源性纤维素酶活力，但是当它与纤维素酶共同作用时对纤维素酶存在一定抑制作用，当反应体系中蛋白浓度为1.2mg/mL时，总酶活和内切葡聚糖酶活最大抑制率分别可达9.78%和52.42%，而对β-葡萄糖苷酶具有促进作用，当溶液体系中蛋白浓度为1.2mg/mL时，β-葡萄糖苷酶活力达到最大增幅71.44%。5)考察蛋白添加顺序对纤维素酶解的影响，可以明确知道何种成分和纤维素结合而影响了纤维素酶作用，结果为当蛋白先与纤维素酶充分结合对酶解的抑制作用更为明显，说明该蛋白可能占有了纤维素酶的活性中心位点，从而降低了纤维素酶活力。