黏菌因其独特的兼具原生动物和真菌某些特征的生活史循环，使其在生物界中的地位一直没有得到统一，同时，黏菌内部成员的组成也在不断变化，为了建立一个更趋自然的黏菌分类系统，本文对团毛菌目Trichtales和绒泡菌科Physaraceae的一些类群的小亚基rDNA进行PCR扩增和序列测定，通过序列比较分析探讨其系统学关系，为建立更趋自然的分类系统奠定基础。 首次对球囊白柄菌的小亚基rDNA部分序列进行PCR扩增和序列测定，分析结果初步表明白柄菌属与绒泡菌目的亲缘关系较近，从而推断将白柄菌属归入绒泡菌目似乎更合理。 对绒泡菌科内4个属5份样品的rDNA小亚基进行了PCR扩增和序列测定，并将其序列与基因库中的相关序列进行了比较分析，结果将供试的绒泡菌科分为两个类群，绒泡菌、光果菌、白柄菌、高杯菌为一个类群；针箍菌和煤绒菌为一个类群。同时从这6个属的系统演化上看，煤绒菌属和针箍菌属在供试的绒泡菌科中为相对原始的类群，高杯菌属次之，白柄菌属较高杯菌进化，光果菌属较白柄菌属进化，绒泡菌属为相对高级的类群。 对团毛菌目内4个属4个样品的rDNA小亚基的部分序列进行了PCR扩增和序列测定，通过序列分析可以初步推断：变毛菌与团毛菌的亲缘关系较近，与半网菌的亲缘关系次之，与团网菌的亲缘关系相对最远。同时从这四个属的系统演化上看，半网菌属为相对原始的类群，团网菌属和团毛菌属为相对高级的类群，变毛菌属介于二者之间。根据本研究结果可以初步推断将团毛菌目分为三个科是相对合理的，因为序列分析结果并不支持将团网菌科与团毛菌科合并。 以上研究为黏菌起源和演化的研究奠定了基础。但由于材料有限，有些类群没有涉及到，还有待进一步补充和完善。