我国目前水资源面临着严峻的形势，中国的水现在面临着洪涝灾害、干旱缺水和水环境恶化三大问题，水已经成为当前制约国民经济发展的最大瓶颈。针对原《水法》规定的水资源管理管理体制存在的问题，新修订的《水法》在水资源管理体制方面进行了改革和完善，确立了流域管理与区域管理相结合和统一管理与具体管理相分离的水资源管理体制。但是水资源管理体制在本质上仍然是单一行政管理模式，新《水法》没有形成水资源的市场调节机制。作为计划经济体制回应的水资源单一行政管理模式，已经不能适应我国市场化改革和对处我国目前严峻的水资源问题的需要，市场机制的引入是我国水资源管理体制变革的方向。水资源问题形成的根本原因在于水资源产权的有效界定及其实现障碍所导致的外部性问题，这是由水资源自身具有的特性决定的，市场和政府在此方面都表现出相应的功能欠缺，水资源问题的解决也必须依赖政府和市场功能的整合。由于水资源具有的独特的自然属性和经济属性，决定在水资源管理体制中应以政府规制为主导，政府规制与市场机制相结合共同促成水资源问题的解决。顺应政府和市场二者功能定位和关系的世界发展趋势：政府和市场由对立与排斥走向功能的整合与互补，水资源管理体制变革必须建立在政府和市场功能的整合与互补的理论基础上，在这一理论基础之上结合我国国情和水资源自身的特点提出我国水资源管理体制变革的指导思想，即在保证政府职能得以有效实施的前提下，充分发挥市场机制的积极作用，建立政府与市场协同合作的机制，在这一思想指导下构建水资源管理体制，是解决我国水资源问题的根本途径。