在多元化的纠纷解决机制中调解极其重要,有助于解决目前复杂的社会纠纷,调解有助于提高民事公益诉讼案件的办案效率,降低诉讼成本,彰显实质正义。将调解作为民事公益诉讼的解决手段也是必然的。但值得注意的是,在公益诉讼的维护下,社会公益是不能随便进行处分的,尤其是在目前我国的公益诉讼主体相对不是很完善的前提下,适用公益诉讼调解时必须要谨慎。同时,相比于其他民事诉讼,民事公益诉讼的目的构造和当事人的地位都存在一定的差异。在民事公益诉讼调解中,要结合公益诉讼的性质,在应用普通诉讼调解的规则之外,再设定相对严厉的限定进行约束,了解并识别其与普通诉讼调解之间的差异性。民事公益诉讼属于民事诉讼,但又具有公益性质,这使其调解制度在适用中和普通的民事诉讼调解存在一定的差异,调解制度和公益诉讼的结合,代表着调解制度的进步,进一步提高了公益诉讼纠纷解决的效率,更好的维护了社会公共利益。司法实践中以调解方式结案的公益诉讼案件日益增多,且司法作为维护社会公平正义的最后一道防线,具有权利救济的功能。而法院所作的调解同裁判一样,都体现着法治化程度,调解的错误可能危害到公共利益甚至国家利益。因此,公益诉讼的调解不应允许公平与正义的缺失,必须完善相关立法,保障公共利益有效救济。本文共包括三部分。第一部分是民事公益诉讼调解的基本理论,阐述民事公益诉讼调解的内涵以及意义。重中之重是分析民事公益诉讼调解与普通民事诉讼调解的差异。第二部分是分析民事公益诉讼调解适用中存在的问题。关于民事公益诉讼调解理论和实践运用,结合具体案例分析,仍然存在较多不足。第三部分是完善民事公益诉讼调解的建议。结合理论和司法实践,根据其存在的问题有针对性的逐一提出建议。