绵羊UCP1基因的多态性及其与生长性状的关联分析

来源 :宁夏大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maigao
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为了筛选出UCP1基因影响宁夏优质肉羊生长发育的差异位点,本研究以宁夏优质肉羊新品种培育工作中的杜泊、小尾寒羊、滩羊三个亲本群体及其杂交后代作为研究对象,利用靶向测序技术检测三个亲本群体的UCP1基因差异位点,并进行了外显子区错义突变的生物信息学分析;利用MassArray基因分型技术检测杂交后代差异位点基因型,分析了不同基因型与生长性状的关联性;主要研究结果如下:1.通过靶向测序技术对三个绵羊品种共91只羊的UCP1基因进行测序,筛选到杜泊羊、滩羊、小尾寒羊三个不同品种间15个差异显著(P<0.05)和24个差异极显著(P<0.01)的位点。2.通过MassArray基因分型技术对384只杂交后代羊中差异位点进行基因分型并与生长性状进行关联分析,结果显示:18692021位点GA型个体在三月龄体高和六月龄体长上显著高于GG型个体(P<0.05);18693226位点TT型个体三月龄体重显著高于CC、CT型个体(P<0.05),TT型个体三月龄胸围显著高于CT型个体(P<0.05);18692054位点-.ACCACCT型个体六月龄体重和体长显著高于-.-个体(P<0.05);18698197位点GA型个体初生胸围显著高于AA型个体(P<0.05),GG型个体三月龄体长显著高于GA型个体(P<0.05);18698214位点GA型个体在初生体长和初生胸围上显著高于AA型个体(P<0.05);18698264位点GG型个体在初生胸围上显著高于GT,TT型个体(P<0.05);18698315位点AG,GG型个体初生体高、体长和六月龄体重上显著高于AA型个体(P<0.05),GG型个体在六月龄胸围上显著高于AA型个体(P<0.05)。上述位点除18698264外,均表现为突变型>野生型。3.本研究在三个品种的杂交后代羊中对上述群体间差异显著和具有多态性的位点进行连锁不平衡分析,共得到3组具有连锁关系的位点,其中:18691776与18692033在杂交后代中存在4种单倍型和5种双倍型,发现的5种双倍型中H4H4(GGCC)型为优势双倍型,关联分析结果显示H3H4型个体三月龄体高显著高于H2H3型(P<0.05);18692223与18693167位点在杂交后代中共存在4种单倍型和3种双倍型,其中H4H4(GGGG)频率最高,为优势双倍型,关联分析显示各双倍型个体间均无差异;18698197与18698214位点在杂交后代中共存在4种单倍型和6种双倍型,其中H4H1(GAGA)频率最高,为优势双倍型,结果显示H4H2型个体初生胸围显著高于H2H2型(P<0.05);H4H4型个体三月龄胸围和体长显著高于H2H2和H4H3型个体(P<0.05),且在三月龄体长上显著高于H4H1型个体(P<0.05),六月龄体高显著高于H4H2型个体(P<0.05)。综上所述,UCP1基因在杜泊羊、滩羊、小尾寒羊三个不同品种间具有多态性,因此可以作为肉羊生长发育和产肉性能方面的候选基因。本试验筛选出的18692021、18692054、18693226、19698197、18698214、18698264、18698315 位点,18691776 与 18692033 位点组成的双倍型 H3 H4以及18698197与18698214位点组成的双倍型H4H4、H4H2在育种中有一定参考价值,今后可以考虑将其作为UCP1基因的重要分子标记进行进一步的研究。
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