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传统的观点认为藻类主要吸收无机氮,近年来发现越来越多的藻类可以直接利用有机氮源。随着人类活动的增加,天然水域中有机氮的占比越来越高,因此藻类利用有机氮的相关研究愈发重要。本研究以模式生物莱茵衣藻(Chlamydomonasreinhardtii)为研究材料,根据不同的氮源(尿素CO(NH2)2和氯化铵NH4Cl),和不同的氮浓度设置实验组,分为缺氮组(氮原子浓度为0mM)、正常氮浓度组(氮原子浓度为7mM,分为正常氨氮组、正常尿素组、正常混合组(尿素、氯化铵各提供3.5mM氮原子))和高氮浓度组(氮原子浓度为70mM,分为高浓度氨氮组、高浓度尿素组、高浓度混合组(尿素、氯化铵各提供35mM氮原子)),以正常氨氮组作为对照,研究了不同氮源及氮浓度处理对莱茵衣藻生长、细胞数、总叶绿素等生化指标的影响,并用qRT-PCR探讨了不同氮源及氮浓度处理下,莱茵衣藻尿素代谢关键酶基因在转录水平的表达情况。本研究还进一步使用CRISPR-Cas9技术对脲基甲酸盐水解酶DUR2基因进行敲除实验,以期为尿素代谢关键酶基因的功能研究奠定基础。
本文主要研究结果如下:
1.不同的氮源及氮浓度培养莱茵衣藻,基础生理结果显示:在3个正常氮浓度组中,培养10d后细胞数范围均在7.0~7.5×106个/mL,组间没有显著性差异(p>0.05)。在高浓度氮源3个组中,细胞数均在1.6~2.0×106个/mL范围内,通过显微镜观察发现高浓度各组中均有3~4个细胞聚集的现象,可能与细胞胁迫产生EPS有关。而缺氮组,培养10d细胞数仅为2.3~5.3×105个/mL。综上可见莱茵衣藻在正常氮浓度下生长是最好的,且以氨氮和尿素为氮源下的生长能力一致。缺氮及高氮源组都能抑制细胞的生长,其中抑制程度最大的是缺氮组。
2.本研究使用qRT-PCR技术分析不同的氮源及氮浓度培养下莱茵衣藻尿素代谢相关基因,发现在缺氮处理下,DUR1、DUR2、3个DUR3基因都显著上调,表明细胞需要加速吸收和降解尿素以缓解缺氮胁迫。在3个正常氮浓度处理组中,仅尿素组可以诱导DUR1、DUR2基因上调表达,但DUR3A、DUR3B基因不受尿素诱导高表达,推测正常氮浓度处理下,尿素的吸收能力是一致的,铵离子的存在不影响DUR3基因表达。高氮浓度下,DUR1基因和DUR2基因都上调表达,DUR3B和DUR3C基因则下调表达,推测细胞可能通过减少吸收氮源,加速降解尿素来缓解高氮胁迫。
3.莱茵衣藻有8个氨基转运载体,其中AMT1;1最为重要。通过qRT-PCR技术检测发现在缺氮处理下,AMT1;1基因短时间内显著上调(p<0.01)表明细胞加速氨基转运以缓解缺氮胁迫。而正常氮浓度处理下,只有尿素组AMT1;1基因表达量升高,进一步分析发现AMT1;1与DUR1基因有类似的表达模式,推测AMT1;1在尿素代谢调控中起重要作用。
4.利用CRISPR-Cas9技术就莱茵衣藻尿素代谢关键酶基因DUR2的功能开展进一步研究。在CRISPR质粒系统中,针对DUR2基因共筛选出2个sgRNA(SaCas9型)位点可用于体内敲除实验,并成功构建该位点的sgRNA表达质粒。通过大量的电转实验和筛选转化子,共筛选转化子1808个,但目前尚未获得阳性克隆子。CRISPR蛋白系统共筛选出3个MAA7基因sgRNA位点,以及2个SpCas9型的DUR2基因sgRNA位点,经验证均可用于体内敲除实验。质粒系统筛选不到阳性转化子主要原因可能是Cas9质粒对细胞的毒害作用以及技术本身敲除基因的概率太低所导致。
本文主要研究结果如下:
1.不同的氮源及氮浓度培养莱茵衣藻,基础生理结果显示:在3个正常氮浓度组中,培养10d后细胞数范围均在7.0~7.5×106个/mL,组间没有显著性差异(p>0.05)。在高浓度氮源3个组中,细胞数均在1.6~2.0×106个/mL范围内,通过显微镜观察发现高浓度各组中均有3~4个细胞聚集的现象,可能与细胞胁迫产生EPS有关。而缺氮组,培养10d细胞数仅为2.3~5.3×105个/mL。综上可见莱茵衣藻在正常氮浓度下生长是最好的,且以氨氮和尿素为氮源下的生长能力一致。缺氮及高氮源组都能抑制细胞的生长,其中抑制程度最大的是缺氮组。
2.本研究使用qRT-PCR技术分析不同的氮源及氮浓度培养下莱茵衣藻尿素代谢相关基因,发现在缺氮处理下,DUR1、DUR2、3个DUR3基因都显著上调,表明细胞需要加速吸收和降解尿素以缓解缺氮胁迫。在3个正常氮浓度处理组中,仅尿素组可以诱导DUR1、DUR2基因上调表达,但DUR3A、DUR3B基因不受尿素诱导高表达,推测正常氮浓度处理下,尿素的吸收能力是一致的,铵离子的存在不影响DUR3基因表达。高氮浓度下,DUR1基因和DUR2基因都上调表达,DUR3B和DUR3C基因则下调表达,推测细胞可能通过减少吸收氮源,加速降解尿素来缓解高氮胁迫。
3.莱茵衣藻有8个氨基转运载体,其中AMT1;1最为重要。通过qRT-PCR技术检测发现在缺氮处理下,AMT1;1基因短时间内显著上调(p<0.01)表明细胞加速氨基转运以缓解缺氮胁迫。而正常氮浓度处理下,只有尿素组AMT1;1基因表达量升高,进一步分析发现AMT1;1与DUR1基因有类似的表达模式,推测AMT1;1在尿素代谢调控中起重要作用。
4.利用CRISPR-Cas9技术就莱茵衣藻尿素代谢关键酶基因DUR2的功能开展进一步研究。在CRISPR质粒系统中,针对DUR2基因共筛选出2个sgRNA(SaCas9型)位点可用于体内敲除实验,并成功构建该位点的sgRNA表达质粒。通过大量的电转实验和筛选转化子,共筛选转化子1808个,但目前尚未获得阳性克隆子。CRISPR蛋白系统共筛选出3个MAA7基因sgRNA位点,以及2个SpCas9型的DUR2基因sgRNA位点,经验证均可用于体内敲除实验。质粒系统筛选不到阳性转化子主要原因可能是Cas9质粒对细胞的毒害作用以及技术本身敲除基因的概率太低所导致。