利用基因组挖掘发现两株海洋链霉菌的生物活性及活性物质初步研究

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海洋环境的特殊性使海洋放线茵产生许多独特的活性化合物,引起了国内外学者的广泛关注。微生物基因组挖掘是一种寻找次级代谢产物的新方法,通过分析微生物的基因组信息,预测其合成天然化合物的潜能,进而根据所获得的信息对化合物进行分离纯化和结构鉴定,从而迅速发现可能的新化合物。基因组挖掘技术已成为微生物天然产物的研究热点,但海洋放线菌的基因组挖掘目前报道的还比较少。本论文对本课题组保存的两株海洋放线菌(硫磺链霉菌L180和星海链霉菌S187)进行了初步的基因组挖掘研究,基因组序列分析表明,L180基因组中存在一个羊毛硫抗生素的生物合成基因簇,该基因簇与来自稀有放线菌的具有抗藤黄微球菌活性的抗生素生物合成基因簇具有较高的相似性。而S187中分析到一个非核糖体多肽类化合物的生物合成基因簇,该基因簇与合成具有抗补体活性抗生素的生物合成基因簇具有较高相似性。根据这些信息推断,硫磺链霉菌L180和星海链霉菌S187可分别产生抗菌活性物质和抗补体活性物质,进一步实验证明了对于两株菌发酵液活性的推断。对硫磺链霉菌L180发酵液的抗菌活性进行了研究,发现其对藤黄微球菌有较强的抗菌活性,对耐药鲍曼不动杆菌具有较弱的抗菌活性,但对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌、枯草芽孢杆菌和肺炎克雷伯氏菌没有抗菌活性。同时利用藤黄微球菌对抗菌活性物质的理化稳定性进行了研究,结果表明,抗菌活性物质在30℃~60℃,pH4-6范围内稳定性良好,蛋白酶处理不影响其抗菌活性。对抗菌活性物质进行了初步纯化,初步定位了HPLC分析中的可能保留时间段。星海链霉菌可能的抗补体活性物质生物合成基因簇中存在一个编码StrR家族的途径特异性调节蛋白基因sinR,为了定位可能的抗补体化合物,构建了sinR基因的过表达突变株,研究了该基因对菌株抗补体活性的影响,结果表明,菌株发酵8d时,过表达sinR菌株抗补体活性明显高于对照菌株。对抗补体活性物质进行了初步纯化,利用正向硅胶对发酵液乙酸乙酯萃取相进行初步分离,得到了有活性的四个组分,其中组分Fr-A-7的活性最高(63%);此外,利用正向硅胶对菌丝体中的活性物质进行分离,菌体先用乙酸乙酯萃取,再用正丁醇萃取乙酸乙酯萃取后的水相,得到了有活性的四个组分,其中组分Fr-B-8的活性最高(58%)。初步定位了目标化合物HPLC分析中的保留时间,约为8.9min。液质联用(HPLC-MS)检测组分Fr-A-7,初步得到了四个符合预测分子量范围的信号。本论文的结果为进一步研究硫磺链霉菌L180和星海链霉菌S187的活性新天然产物奠定了基础,并为进一步开发海洋放线菌的基因资源提供了有价值的信息。
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