组蛋白甲基化转移酶KMT2C在乳腺癌中突变特征分析

来源 :南方医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:MagicStone2005
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背景:随着现代医学诊疗技术的飞速发展,精准诊疗已成为乳腺癌患者治疗的重要发展方向。二代基因测序技术(Next Generation Sequencing,NGS)的应用,让人们对乳腺癌分子生物学层面有了全新的认识。有研究表明,编码组蛋白甲基化转移酶家族的相关基因C(histone lysine methyltransferase 2C,KMT2C)是表观遗传修饰重要的编码基因,且可能与乳腺癌的发生发展相关。目前,中国乳腺癌患者中KMT2C基因突变状况及其与临床特征的关系尚不明确。目的:探讨KMT2C基因的突变情况及其与临床病理特征相关性,为乳腺癌在基因诊断层面及个体化精准治疗方面提供一定的临床依据。方法:本研究中心(Guangdong Provincial People’s Hospital,GDPH)回顾性收集了2017年6月1日至2018年9月27日期间初治乳腺癌患者的临床特征及其经NGS检测原发肿瘤组织中KMT2C基因的测序结果。使用χ2检验或Fisher检验对患者的临床病理特征及KMT2C突变进行相关性分析,并与TCGA、METABRIC数据库中收录的患者信息和KMT2C突变情况进行对比分析。最后,采用COX比例风险模型对TCGA、METABRIC数据库中的病例进行生存分析,分析影响患者总生存(overall survival,OS)的因素,显著性检验水准α=0.05。结果:本研究中心411例乳腺癌患者检测到33例患者发生KMT2C突变,共36例突变位点,其突变率为8.0%(33/411)。在检测到36例突变位点中有25例KMT2C新发突变位点,并在既往报道过的11例突变位点中,有6例突变位点首次在乳腺癌中发现。此外,KMT2C突变在本中心浸润性小叶癌患者中突变率达到30.8%(4/13)。对比TCGA、METABRIC数据库,两者突变率分别为7.0%(69/981)和14.5%(211/1454)。而三组数据库中KMT2C在发病年龄大于50岁患者更容易发生突变(GDPH:p=0.007;TCGA:p=0.005;METABRIC:p=0.015);且均在HR+/HER2-分子分型更为多见(GDPH:p=0.047;TCGA:p=0.032;METABRIC:p=0.046)。对TCGA、METABRIC组患者KMT2C突变情况与临床病理特征进行COX风险回归分析,发现KMT2C突变不是乳腺癌预后的相关危险因素(TCGA:HR,1.71;95%CI,0.88-3.31;p=0.111;METABRIC:HR,2.03;95%CI,0.45-3.08;p=0.419)。结论:本研究结果首次探索了KMT2C基因在中国乳腺癌患者中突变特征。在中国人群中,KMT2C突变更多见于HR+/HER2-、浸润性小叶癌、年龄较大绝经后的女性乳腺癌患者,本研究中心还在中国人群中发现25例新发突变位点。此外,首次对比了以西方人群为主的公共数据库,发现KMT2C突变均多见于HR+/HER2-老年乳腺癌患者中,这预示着KMT2C突变可能为乳腺癌个体化治疗提供一定的理论依据。未来,我们将进行中国患者新发突变位点的功能研究,并扩大样本量,进一步探索中国乳腺癌患者KMT2C的突变特征及临床应用价值。
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