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【目的】：研究组蛋白甲基化酶G9a、组蛋白H3K9me1、组蛋白H3K9me2在175例胃癌的表达差异及临床意义。观察siRNA干扰沉默G9a基因后对胃癌MGC803细胞株细胞生物学的改变、组蛋白甲基化及乙酰化的影响，探讨其可能的机制。【方法】：1、免疫组织化学方法检测胃癌、慢性浅表性胃炎、萎缩性胃炎、中重度不典型增生标本中甲基化酶G9a、组蛋白H3K9me1、组蛋白H3K9me2蛋白的表达差异，统计学分析探讨其临床意义。2、设计针对G9a基因4个小干扰RNA片段，经Lipofectamine2000脂质体转染入MGC803细胞，RT-PCR及蛋白免疫印迹法（Western Blot）筛选最佳干扰片段。3、MTS法绘制G9a基因干扰沉默后MGC803细胞的生长曲线，TUNEL分析细胞调亡。4、Western blot检测G9a基因干扰沉默后对MGC803细胞凋亡相关蛋白BCL-2、Procaspase-3、Bax；组蛋白H3K9me1、H3K9me2、H3K9me3、组蛋白H3K27me1、组蛋白H3K27me2、组蛋白H3乙酰化状态的影响。【结果】：1、胃癌组织中组蛋白甲基化酶G9a的阳性表达为87.43%（153/175），H3K9me2为90.28%（158/175），上述两者显著高于浅表性胃炎（33.33%、36.67%）、萎缩性胃炎（43.33%、40.00%）、中重度不典型增生（46.67%、56.67%），p<0.05，有统计学意义；与胃癌的分化程度、浸润深度、淋巴结转移及TNM分期相关。组蛋白H3K9me1在胃癌及其它各组比较未见明显的差异，胃癌50.86%%（89/175），浅表性胃炎53.33%(16/30)，萎缩性胃炎50.00%（15/30）、中重度不典型增生56.67%（17/30），p>0.05，无统计学意义。2、筛选出组蛋白甲基化酶G9a最佳干扰片段，序列为：正义链5’-UUCAGUCUCUACUAUGAUUTT-3’，反义链5’-AAUCAUAGUAGAGACUGAATT-3’。3、G9a siRNA能下调G9a基因的mRNA和蛋白表达，抑制MGC-803细胞增殖；下调抑制凋亡基因BCL-2，上调Bax表达增强，启动效益蛋白Procaspase-3，诱导细胞凋亡。4、G9a siRNA下调组蛋白H3K9me1、H3K9me2及组蛋白H3K27me1、组蛋白H3K27me2水平，而对组蛋白H3K9me3及组蛋白H3乙酰化无影响。【结论】：1、胃癌组织中组蛋白甲基化酶G9a、H3K9me2高表达，与病理分化程度及淋巴结转移等相关，提示G9a、H3K9me2可能有促进胃癌的发生、发展和浸润、转移的作用。2、干扰沉默G9a基因，可以抑制胃癌细胞增殖，启动凋亡程序、诱导肿瘤细胞凋亡，进一步研究发现组蛋白H3K9、H3K27甲基化改变导致染色体构象改变可能是其机制，G9a基因可能为胃癌基因靶向治疗的标靶。