国家大学科技园是国家创新体系和中国特色高等教育体系的重要组成部分，一流的国家大学科技园是一流大学的重要标志。在政府有关部门、地方政府和高等学校的共同推动下，国家大学科技园的建设和发展取得了显著成效，已经成为转化高新技术成果、孵化高新技术企业、培育战略性新兴产业和高校师生创业的重要基地。随着城镇化的不断推进，大专院校纷纷在郊区大学城建立自己的新校区，市中心的校区的资源就成为大专院校因其自身利益实现自身市场化的空间载体，同时位于中心城区的地方政府为了解决经济指标的压力和所剩无几的空间的矛盾，也乐于同大专院校合作共同打造国家大学科技园。通过对于国家大学科技园的相关人员进行访谈，同时将不同的科技园进行比较，揭示出国家大学科技园的发展主要和大专院校、地方政府和企业三方有着各种错综复杂的关系。三方根据自身不同的利益诉求，在建设国家大学科技园这一个问题上有着自己不同的视角和观点，直接导致在这一过程中表现出来的积极性、主动性各不相同。由于不同的利益诉求，相关各方在国家大学科技园的建设和发展上就有着各自不同的打算。对于大专院校来讲主要解决科研成果转化，科研成果产业化，创业、就业问题；对于地方政府来讲就是拓展税源，拓展招商的空间载体，与大专院校合作推进区域科技创新；对于企业来讲，享受优惠的孵化政策以利于创业的成功，寻找科技园背后的大专院校科研资源提升企业的竞争力。国家大学科技园因其自身的经济部门属性和第三部门属性，且涉及的利益主体众多，通过多方共治的模式来推动科技园的建设。三方都要在国家大学科技园这样一个平台上寻求自己利益的最大化，一般还是遵循谁付出谁享受的原则，当地方政府主推模式时地方政府占优，当大专院校自治时大专院校占优，当实行公司董事会制时根据出资比例在董事会中谋求自己的利益。在发展的不同阶段选择适合自己的运行模式。简单地看，公司董事会制是现代企业治理模式，科技园运营公司将获得更多的自主权，但这一模式对于前提条件的苛刻一般不可能一蹴而就，是需要一个逐步发展变化，需要地方政府和大专院校的决策层改变固有的行政思维，转变为市场的思维来审视国家大学科技园的建设，同时相关的经济条件允许的前提下才能实现公司董事会制的来运营国家大学科技园。本文试图通过对国家大学科技园各种不同运行模式的研究，归纳出适合现今国情的国家大学科技园发展路径，并揭示地方政府、大学和企业在国家大学科技园中的利益格局，从而提炼出适合国家大学科技园的运行模式。