蓖麻是重要的经济作物和工业用油作物。由于其遗传基础狭窄和遗传研究相对滞后,限制了育种水平的提高,致使生产上缺乏高产、抗病品种。本试验以171份华南野生蓖麻种质资源构成的自然群体作为研究对象,对产量、株型、花期、裂蒴性等35个主要性状进行了多样性评价和基于SSR标记的全基因组关联分析。主要结果如下:1、通过对171份蓖麻材料15个质量性状的研究表明,华南地区野生蓖麻主要有3种类型。第一种类型也是最为常见的类型表现为:第一种为叶裂浅、有刺且表现密集的球形蒴果、花序较短、叶青色;第二种类型表现为叶裂很深,表现如同木瓜叶的材料;第三种类型为茎、叶和果都为紫色的蓖麻材料。20个数量性状的变异系数范围为0.16-0.97,平均值为0.50,变异系数最大达0.97,变异幅度为1-85。35个目标性状的Shannon’s信息指数范围为3.76-4.71,平均值为4.39。选用的71对多态性SSR引物在群体中共检测到266个等位变异,每个位点等位变异2-10个,平均为3.705个,Shannon’s信息指数平均值为0.980,多态信息含量平均值为0.480。表型数据分析和分子数据分析结果都表明华南野生蓖麻群体的遗传多样性高于以往关于其它蓖麻群体的研究。2、群体结构分析将供试材料群体分为3个亚群。邻接法(Neighbor-joining,NJ)聚类分析将供试材料也分为3个类,两种分析结果一致。3、利用Q+K的MLM模型进行关联分析,共检测到显著关联位点27个,与花期、产量、株型和粒型相关联的位点分别为4、12、7和4个,其中极显著关联的位点为12个。以上结果对华南蓖麻野生种质资源的保护、利用及蓖麻分子辅助选择育种有重要意义。