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目的：本研究检测HPV16E7，E5序列变异在新疆地区维吾尔族，汉族妇女宫颈癌及癌前病变中的发生情况，探讨HPV16E7，E5基因变异率在新疆地区维吾尔族，汉族妇女不同宫颈病变中的相关性。方法：对HPV16DNA阳性的119例宫颈炎（维54例，汉65例）、70例CINI（维30例，汉40例）、91例CINII-CINIII(维45例，汉46例)和105例宫颈癌（维60例，汉45例），对其E7和E5PCR扩增进行测序后对比，分析突变情况。结果：除了HPV16E7和E5的原型序列以外，HPV16E7最常见的变异为A647G和T846C，主要以A647G突变为主，A647G变异株频率在不同宫颈病变中为宫颈炎（维22.2%，汉24.6%）、CINI（维60.0%，汉55.0%）、CINII-CINIII（维57.8%，汉60.9%）、宫颈癌（维55.3%，汉66.7%）；HPV16E5最常见的变异为A4042G和A3978C,主要以A4042G突变为主，A4042G变异株频率在不同宫颈病变中为宫颈炎（维18.5%，汉21.5%）、CINI（维53.3%，汉45.0%）、CINII-CINIII（维53.3%，汉56.5%）、宫颈癌（维55.0%，汉68.9%）；HPV16E7A647G变异株和HPV16E5A4042G变异株在新疆地区维吾尔族，汉族妇女各个宫颈病变阶段中的总体分布差异有统计学意义（P<0.05），比较维吾尔族，汉族妇女宫颈癌及癌前病变中的HPV16E7A647G变异株和HPV16E5A4042G变异株的分布差异无统计学意义（P>0.05）。结论：HPV16E7A647G变异株和HPV16E5A4042G变异株是新疆地区维吾尔族，汉族妇女宫颈癌及癌前病变中流行的变异株，此变异株在维吾尔族，汉族妇女各个宫颈病变阶段中的总体分布有差异性，即此变异株与宫颈病变的程度有相关性；在维吾尔族，汉族妇女宫颈癌及癌前病变中的分布比较无差异性，即此变异株在新疆地区宫颈病变中无民族差异性。