癌症相关的SF3B1突变造成DVL2异常剪接机制的研究

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guxleo3322
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:RNA剪接是真核生物基因表达的关键步骤之一。剪接因子SF3B1是U2小核糖核蛋白复合体(U2 sn RNP)的组成部分[1-3]。研究发现在多种癌症中均存在SF3B1的高频率突变,且SF3B1突变可使一些基因在3′端发生异常剪接[4-8]。在SF3B1突变的慢性淋巴细胞白血病细胞中,DVL2在3′剪接位点发生异常剪接,并导致其第11外显子上72个核苷酸的缺失,从而产生DVL2异构蛋白,由此增强Notch信号通路[9]。然而,SF3B1突变如何造成DVL2异常剪接的分子机制尚不完全清楚。目的:在293T细胞中探究SF3B1突变造成DVL2异常剪接的分子机制,确定DVL2异常剪接和正常剪接的分支点(BP),分析正常剪接与异常剪接的分支点序列(BPS)与U2 sn RNP的亲和力,以及分支点距3′剪接位点的距离对U2sn RNP选择分支点进行剪接的影响,进一步明确DVL2的异常剪接是否依赖于正常剪接的Py tract(多聚嘧啶区)以及正常3′剪接位点。方法:在大多数癌症中SF3B1突变频率最高的是K700E突变,以K700E突变型为代表,探究SF3B1突变造成DVL2异常剪接的分子机制。使用在线工具SVM-BPfinde来预测DVL2正常剪接和异常剪接的候选分支点,并通过点突变实验验证DVL2正常剪接和异常剪接的分支点。将DVL2正常剪接和异常剪接分支点序列互换位置后,验证正常剪接和异常剪接分支点序列与U2 sn RNP结合的偏向性。另外,将DVL2正常剪接和异常剪接Py tract突变及删除后,验证正常剪接和异常剪接是否使用相同的Py tract。结果:我们的研究表明,通过SVM-BPfinder预测DVL2选择性剪接的分支点,并通过点突变实验证实了异常3′剪接位点上游第16位的腺苷酸为DVL2异常剪接的分支点,正常3′剪接位点上游第34位与第24位的腺苷酸都可作为DVL2正常剪接的分支点被使用。正常剪接和异常剪接BPS互换之后,SF3B1突变使U2 sn RNP更偏好使用与其具有高亲和力的BPS来介导RNA的剪接。DVL2的正常剪接使用两个BP进行剪接,通过对这两个正常剪接的分支点所在的BPS进行分析,将正常剪接的BPS1(正常3′剪接位点上游第34位腺苷酸所在序列)与BPS2(正常3′剪接位点上游第24位腺苷酸所在序列)互换之后,BPS1在DVL2的正常剪接中起主要作用,说明BPS的选择不仅取决于它与U2 sn RNP的亲和力,而且与BPS距3′剪接位点的距离有关。结论:癌症相关的SF3B1突变造成DVL2异常剪接不依赖于DVL2正常剪接的Py tract区域以及正常3′剪接位点。
其他文献
随着无人机相关技术的发展,多旋翼无人机作为航空器产品领域的一枝独秀,以新颖的结构布局、独特的飞行方式和广泛的用途迅速成为国际上新的研究热点。多旋翼飞行器是利用旋翼转动产生升力进行能量转化和传递,其动力系统性能直接影响飞行品质。目前,多旋翼飞行器动力系统性能研究存在的问题为旋翼气动模型的建立受实验装置/系统的局限性,多基于理论分析或数值模拟的结论,建模的假设条件多,旋翼与空气相互作用不确定,其模型精
数控刀架作为数控机床的重要功能部件,其服役性能直接影响零件的加工精度和设备的使用可靠性,进而对整机的可用性产生影响。因此,对数控刀架在生产环境下的健康状态进行有效的评估,有助于开展故障预警和预防性维护,提高生产效率并降低故障率,对数控机床整机可靠性水平的提升至关重要。然而由于数控刀架结构复杂、工况多变、故障模式多样、故障样本数据稀少等原因,关于数控刀架的健康状态评估方法与应用尚不完善。针对数控刀架
微型扑翼飞行器是一种仿昆虫和鸟类的飞行器,它具有稳定性高、机动性能好、体积小等众多优点,有着良好的应用前景。气动性能是设计微型扑翼飞行器重要的指标之一。由于扑翼微型飞行器的空气动力学特征和普通飞行器完全不同,目前并没有完善的理论来分析其气动力特性,只能通过风洞实验的方式测量其气动力特性。扑翼飞行器的重量轻,扑动时各分量力较小,不易测量。因此,本文研制了适用于微型扑翼飞行器的应变天平,主要研究内容如
目的:通过研究靶向miR-140-3p影响信号通路的表达,为治疗骨质疏松症提供新的依据。材料与方法:骨质疏松症(OP,osteoporosis)是一种骨代谢紊乱,严重影响老年人和绝经后女性的生活质量的全身性疾病。本研究纳入健康志愿者和绝经后OP患者。通过双能X射线吸收测定法(DXA)检测骨密度(BMD)。通过培养CD14-PBMCs和C2C12细胞,分别诱导破骨细胞分化和成骨细胞分化。通过Targ
Ti6Al4V具有出色的机械、物理和化学特性,被广泛用于国防、航空航天、生物医学等领域,但是其本身固有的一些缺点,如高摩擦系数、低硬度和耐磨性等,在一定程度上限制了其工业应用范围。表面微结构加工作为一种典型的表面改性方法,可赋予材料表面一些新颖的功能,提升其应用潜力。由于具有绿色、灵活、高效等特点,激光表面微结构加工成为此领域内的研究热点,但是目前仍然面临一些困境,包括微结构形成机制尚未统一、缺乏
SLAM包含定位和建图两层意思,本文首先设计了机器人运动模型,确定地图模型为拓扑图和栅格图。然后对基于粒子滤波的EKF和Gmapping算法展开分析,分别通过仿真进行了验证。分析结果表明EKF-SLAM局限性较大且算法复杂度较高,但是对其他SLAM算法具有指导意义。Gmapping算法基于粒子滤波算法实现,仿真建图结果误差量较小,需要现场实验验证具体算法运行情况。然后分析Hector-SLAM算法
齿形链又被称为无声链,因其具有较高的传动精度、较低噪声和优良的耐磨性等特点在机械传动领域得到了广泛的应用。本文依托于国家自然基金项目:齿形链的变异机理及其关键技术研究(No.51775222)和吉林省科技发展计划重点研发项目:乘用车混合动力用发动机正时链系统关键技术研究(No.20200401136GX),对四驱汽车的分动器用链传动系统进行了设计和分析。本论文阐述了分动器用链传动系统的研究现状,阐
由于化石资源的枯竭以及严重的环境污染,生物质可降解材料的利用越来越受到许多研究学者的关注。然而,目前使用的高吸水性材料大多数是以石油为原料生产的,由于合成类高吸水性材料的成本高、潜在毒性大,其降解性和生物相容性差,存在潜在的环境危害。因此,基于天然高分子材料的吸水材料的研究逐渐成为近年来的研究热点之一。纤维素是最丰富的生物质材料,其来源广泛,是许多产品的理想原料。将纤维素掺入到高吸水性材料中,既能
小学语文阅读教学的高质高效开展,对锻炼学生的阅读理解能力,促进学生形成良好的语言构建和运用素养、培养学生灵活敏锐的思维,提升思维素养、引导学生以正确的态度看待事物,形成良好审美鉴赏和创造素养、丰富文化知识储备,形成文化的理解和传承素养等语文核心素养皆有着至关重要的作用。在新课程标准不断深化改革的背景下,小学语文教师要以全新的教学理念深研阅读教学中存在的不足,并有针对性创新实施教学策略,从而借助高质
拖拉机姿态自调整转向驱动桥是拖拉机的主要承力部件,由于其作业环境是山地、丘陵这样条件恶劣的区域,驱动桥在初始设计中往往通过加大壁厚等措施以增加自身强度、提高拖拉机的适应能力。但这也导致了拖拉机自身重量增大,反而不利于拖拉机在山地丘陵地区的作业。所以有必要对其进行优化设计从而实现减重的目的。自调整转向驱动桥作为拖拉机的重要部件之一,对其进行优化设计工作也可对未来开展拖拉机整机的优化设计提供参考。本文