利用果蝇模型研究pygo新型信号途径

来源 :湖南师范大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:randygu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
wg/Wnt信号在心脏发育和心脏衰老过程中发挥重要的作用。pygo作为Wnt信号途径的一个新成员,依赖于Wnt信号调控心脏发育。本研究室的最新结果表明,敲低pygo表达导致严重的成体心脏功能突变表型,而敲低Wnt/β-catenen-TCF信号成员的表达导致的突变表型,明显低于pygo的表型水平或无表型。另一方面,TCF的显性负突变引起与pygo表型一致的严重成体心脏生理功能缺陷,提示pygo调控成体心脏功能不依赖于经典Wnt信号,可能依赖与TCF类似因子相互作用而发挥功能,存在新的调控机制。因此,利用果蝇心衰模型,探究新型的pygo分子调控途径成为了我们的研究重点。为了探究pygo在果蝇成体心脏中的分子调控机制,本文采用了染色质免疫共沉淀结合高通量测序(ChIP-seq)的方法鉴定pygo基因调控成体心脏功能的新靶点,首先,运用成体心脏功能分析系统验证了pygo在维持成体心脏功能中的重要功能。其次通过果蝇杂交实验构建了心脏特异性(hand 4.2 Gal4)驱动UAS-HA-pygo过表达标签稳定系,采用免疫荧光实验方法证明了HA抗体的有效性,检测到Pygo蛋白在心管的表达。同时,剥取过表达果蝇品系心管,用甲醛交联,并用超声波将其打断成一定长度的小片段,取一部分染色质作为Input,其余分别加特异性HA抗体,以及阴性对照IgG抗体,解交联,纯化DNA,最后对文库DNA进行验证、质检、高通量测序。测序后对结果进行多方面处理,去污染及接头、将测序转化为可视化数据;通过MACS方法追踪到799个重要基因组特征峰值,并对其基因结构进行了分类,使用最新的UCSC浏览器对数据进行结构和功能注释;对峰值信号进行GO富集聚类分析,Pygo相互作用基因的功能主要定位在染色体结构变化和修饰过程中;分析转录起始位点TSS附近的峰值分布特征并对三个重复样品进行启动子峰值交叉分析,找到120多个代表基因;并对三个重复样品进行信号通路分析,定位到11条重要的信号通路。通过综合分析我们初步定位到26个Pygo蛋白可能调控的候选基因。目前,候选基因的鉴定还在进一步进行中。
其他文献
针对便携式傅里叶变换红外光谱仪测量比辐射率的不确定性,提出了三种改进的波谱比辐射率测量方法.方法1和方法2借助于附加设备改变环境辐照度实现病态方程可解.方法3基于灰体
背景神经钙粘蛋白(N-cadherin)是钙粘蛋白家族成员中最早在鸡胚神经管中被发现,主要在神经系统中介导细胞黏附,影响神经细胞的分选、迁移、定位及轴突生长和路径选择。在细胞内
目的探讨基于肌酐估测值的RIFLE标准对冠状动脉搭桥术后患者急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的诊断价值。方法收集2007年1月至2009年1月在上海同济大学附属同济医院胸外科
本文的研究对象是包含1的,并且代数半群是半单的不可交换的有限半群.分析有限半群中元素的性质,把有限半群S中的元素可以分为4类.设s是S中一个元素.第一类是存在M∈N,使得sM
目的探讨妊娠期糖尿痛患者妊娠结局的影响。方法对78例妊娠期糖尿病(GDM)患者给予糖尿病规范化治疗,与同期非糖尿病产妇80例比较妊娠结局。结果观察组妊娠期高血压疾病、羊水过
前牙反(牙合)是儿童时期常见的一类错畸形,其临床表现为患儿正中咬合时前牙呈反覆、反覆盖关系。此类错畸形可能会随着患儿的生长发育症状进一步加重,不仅影响正常的口腔功能和
近年来,随着电磁屏蔽材料的发展,聚合物复合材料、膜材料及三维结构材料在电磁屏蔽领域都涌现出大量的研究成果;而为了给人体及柔性电子器件提供一定的电磁防护,柔性可穿戴电磁屏蔽材料也亟待发展。本论文中,借助新兴的二维导电纳米材料MXene,向商业纺织品赋予电导性,实现传统纺织品的多功能化,并在电磁屏蔽领域表现出优良的性能。本论文具体研究内容及创新成果如下:(1)通过LiF/HCl体系成功实现对Ti3Al