虎纹蛙病毒(TFV)部分基因毒力的RNA干扰鉴定

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本研究主要用RNAi的方法,对虎纹蛙病毒(TFV)部分基因进行毒力鉴定。 通过体外转录(invitrotranscription)的方法,合成TFV部分基因特异的siRNA,把siRNA转染FHM细胞,随后进行TFV感染。通过定期观察细胞病理变化(cytopathogeniceffect,CPE)的方法,直接检测siRNA对病毒增殖的影响;应用半定量RT-PCR(Sq-RT-PCR)的方法进行基因表达分析,检测siRNA对基因表达水平的影响;同时应用病毒滴度(TCID50)测定的方法,检测病毒量及其毒力。通过分析基因表达水平(Sq-RT-PCR)与CPE及TFV滴度的关系,初步鉴定TFV毒力相关的基因,进一步发掘有研究意义的基因及其功能。 首先在48孔板中优化了转染条件:应用Lipofectamine2000TMReagent将体外转录的siRNA导入FHM细胞,每孔转染浓度为500nM,转染体积为80μl。 干扰实验对TFV的63个ORF进行筛查,初步鉴定出其中的30个可能与TFV毒力相关,包括ORF003,004,007,010,015,022,023,025,029,032,035,036,038,041,045,048,050,051,053,057,065,074,076,077,084,087,097,099,100和104。其中,16个对TFV增殖和毒力可能起到至关重要的作用:ORF010,015,022,025,035,036,038,041,045,048,051,065,077,087,097和104;14个与TFV毒力相关,可能起到次重要的作用:ORF003,004,007,023,029,032,050,053,057,074,076,084,099和100。 对ORF087,097,016和022进行深入研究,应用Sq-RT-PCR和测定TCID50的方法,分别检测病毒感染24,36,42,48和60h后基因的表达水平和病毒量及病毒毒力,建立了一套比较完善的TFV全基因组RNA干扰的研究方法,为以后全面开展深入研究搭建了良好的技术平台。
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