家猪ATRN基因多态性及其与重要经济性状的关系研究

来源 :湖南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:coosmic
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Attractin(mahogany/mg)是常染色体隐性基因,在近几十年里受到很大关注。已经发现attractin在黑色素沉着、调节运动行为和基础代谢、中枢神经的形成及功能、协调T细胞与巨噬细胞之间的反应等方面都起着十分重要的作用。ATTRACTIN蛋白可以抑制因多食而引起的肥胖,其在大脑中的表达水平与抑制肥胖症成正相关,而且鼠类attractin基因位于包涵几个体重和肥胖QTL区域内。本研究以丹麦Pig Research Station Sows and Piglets培育的一个复杂近交家猪家系(CUP家系)0-6代中的193头家猪以及湘黄猪129头、本地猪种257头为试验材料,采用PCR-RFLP分子标记对attractin基因座位点进行分析,主要结果如下: 1.用TaqI限制性内切酶对PCR产物进行消化,在外来猪种(CUP家系主要含长白和大约克血缘、湘黄猪主要含杜洛克和皮特兰血缘)中能够得到ATRN三种基因型AA、AB、BB,呈现多态性;在本地猪种(大围子猪、宁乡猪、沙子岭猪)中只表现出BB基因型,无多态性;各猪种ATRN基因座的PCR-RFLP基因型x~2检验结果表明:外来猪种间及每个外来猪种ATRN基因座的PCR-RFLP基因型分布与3个本地猪种的相比都差异极显著(P<0.01),三个本地猪间ATRN基因座的PCR-RFLP基因型分布完全一致。 2.采用CRI-MAP V2.4软件对CUP家系资料进行连锁分析发现attractin基因座位与17号染色体sw1031位点连锁,重组率和LOD值分别为0.21、3.19,为构建详细的连锁图提供依据。 3.根据外血猪种存在的多态性,分析了attractin不同基因型与生产性能的关系。结果表明:在CUP家系中,三种基因型对于日均屠宰重的影响基本上无差异;三种基因型间屠宰重有些差异,但并不显著;而三种基因型对于背膘厚存在着显著的差异(P<0.05),BB基因型个体背膘最薄,AB基因型个体居于中间,AA基因型个体所表现出的背膘最厚。湘黄猪中,表现为背膘厚以BB型优于AA型和AB型的趋势。总的看来,外来品种中,BB型个体背膘最薄。 4.本地猪种的背膘厚通常比外来猪种厚,但本研究在本地猪a t t r a c t i n基因座位点无多态性,只有 BB型,这与外血猪种 BB型最薄似乎产生了矛盾,本人认为主要是由于:①实验的样本含量不够,引起抽样误差,未能检测到其它基因型;②所设计引物的局限性,尚不能在本地猪该片断区中检测到多态,该引物只适应于外血猪种;③不同的遗传背景所造成的,外来猪与本地猪种间存在着较大的差异,降低了可比性。这些发现,为对ATRN研究提供了新的思路。 5.利用本实验设计的引物对所有家猪材料PCR 扩增出来的attractin基因座位点产物约为890hp,与Edeal等人2000年报导的980hP有较大的出入,经准确核对所公布基因序列后,推测890hP可能是比较准确的。 6.本研究表明,在外血猪种中attractin存在着多态性,与影响背膘厚的微卫星位点连锁,且BB型对于背膘厚有着显著效应,等位基因间以加性效应为主(P<0.05),所有这些为attractin能否作为背膘厚的候选基因提供了可行的方案及理论依据。
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