水杉野生个体的DNA识别和空间分布格局

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水杉(Metasequoia glyptostroboides)被誉为“活化石”植物,其野生种群仅分布在我国湖北省利川市、湖南省龙山县和重庆市石柱县的小范围狭窄区域。完成水杉的个体DNA识别能够提高种群遗传监测的准确度,有利于从遗传角度对水杉的保护和管理工作。本研究利用微卫星分子标记方法,使用12个多态性较高的微卫星位点对所有5636株野生水杉个体进行遗传分析并对其进行DNA个体识别研究,构建等位基因与面积的关系曲线。得到主要结论如下:(1)基于高通量测序法,开发出水杉的28对多态性高、重复性好的微卫星引物,可用于其种群遗传学研究。(2)选择上述其中的4个以及原有的8个共12个微卫星位点用于分辨野生水杉个体,结果表明遗传分辨率达到99.77%,任意两个个体的一致性概率值足够低(P ID=4.6×10-12,P IDsib=6.2×10-5),表明12个SSR位点可以很好地将所有水杉个体区分开来。(3)基于贝叶斯法和空间插值法对种群遗传结构分析显示,所有水杉个体可聚为2类遗传种群,2个遗传种群分别位于分布区的东部和西部,东部种群与西部种群之间存在中等强度的遗传分化(FST=0.0796)。西部种群可进一步划分为西北部和南部两个亚种群,两者之间的遗传分化程度很低(FST=0.0254)。(4)当划分为两个种群时平均等位基因数(A)为14.2917,平均等位基因丰富度(AR)为13.4896,平均观察杂合度(HO)为0.5719,平均期望杂合度(HE)为0.6201;当划分为三个种群时平均等位基因数(A)为14.1944,平均等位基因丰富度(AR)为14.6017,平均观察杂合度(HO)为0.5622,平均期望杂合度(HE)为0.6264。(5)野生水杉种群基本呈聚集分布,在排除生境异质性影响后随着研究尺度的增大由明显的聚集分布逐渐变为随机分布。(6)种群等位基因–面积关系的拟合方程为y=12.832x0.4545,与均质泊松过程模拟下的曲线存在显著差异,实际分布中等位基因数量在取样面积为665.64km~2时不再继续增加。
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