大肠杆菌UbiG的结构探索及人源Trm6/Trm61的表达纯化

来源 :中国科学技术大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liqiang20010
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一、大肠杆菌UbiG的结构生物学研究   泛醌(辅酶Q,CoQ)是一种脂溶性的小分子,属于苯醌类物质,存在于原核生物的质膜和真核生物的质膜及其它细胞器膜上,如线粒体内膜,溶酶体膜等。在不同的生物中,泛醌发挥不同的生物学功能。而其最重要的功能就是在原核生物和真核生物中,作为氧化呼吸电子传递链的关键成分,负责将电子从复合物Ⅰ和Ⅱ传递到复合物Ⅲ,产生ATP。泛醌的合成不仅需要苯醌头部与异戊二烯单位的尾部的组装,更需要苯环上的各种修饰,如去羧基化,羟基化,氧甲基化,碳甲基化等。UbiG和Coq3即分别是大肠杆菌和真核生物中参与泛醌合成途径的氧甲基转移酶,都催化两步氧甲基化反应。已有的研究表明,真核生物的Coq3和大肠杆菌的UbiG可以催化类似底物的氧甲基化反应。这说明,两种酶的催化机理应该是差别不大的。由于Coq3不能有活性的外源表达,因此,对UbiG及其底物复合物的结构探索,有助于解释此类酶家族的催化机制。   我们在大肠杆菌中克隆,表达,纯化,结晶了UbiG的晶体,并解析了其三维结构。结构显示,UbiG保留了甲基转移酶(Methyltransferase,MTase)超家族经典的折叠方式。根据我们的实验结果,对UbiG的生物学功能发挥作了初步探讨。   二、人源Trm6/Trm61的克隆表达纯化与晶体生长   tRNA(transfer RNA),是蛋白质翻译机器中的必需成分之一,tRNA主要的生理功能是在蛋白质生物合成中转运氨基酸和识别密码子,因此,它对细胞的生长和增殖及器官的发育起着决定性作用。tRNA生物合成包括tRNA基因的转录、转录后的加工和修饰。成熟的tRNA分子中存在众多的修饰成分。在这些修饰中,存在于T环的第58位碱基腺嘌呤核苷酸(A)N1位的甲基化(tRNA mlA58)修饰,是存在于原核生物,真核生物及古细菌中的一种保守的修饰方式。在酿酒酵母中,tRNA mlA58甲基转移酶(Mtase)活性,是由基因TRM6(GCD10)和TRM61(GCD14)编码的两个蛋白亚基共同承担的的。这种修饰,对起始tRNAMet的稳定性是必须的。人源的tRNA mlA Mtase—hTrm6/haTrm61复合物与酵母中此类蛋白具有功能及结构的相似性,不同之处,在于,人源的mlA58修饰的tRNA—Lys在HIV的复制过程中有重要作用,而mlA58又是tRAN在此作用过程中必不可少的。   为了能够更清楚的了解Trm6/Trm61催化tRNA mlA58甲基化的分子机制和二者之间如何的相互作用,我们克隆、表达、和纯化了Trm61和Trm6全长及其片段,进行了晶体生长。  
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