绵羊Leptin基因SNPs多态性及其与生长发育性状的相关性分析

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本研究是以典型群随机抽样方法采集3个国外引进品种(包括无角陶赛特121头、萨福克72头、得克塞尔73头)和国内品种滩羊89头。利用PCR-SSCP技术对这4个绵羊品种358个个体Leptin基因2、3外显子进行多态性分析,以及该基因与生长发育性状间的相关性研究;同时利用MEGA 4生物软件构建绵羊、山羊、水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡等物种间的系统发生树。结果如下:1.在Leptin基因外显子2上未发现突变;内含子2上存在A99G、G115A、C150T、C171T 4个SNP位点,G115A和C171T为两个新发现的多态位点;外显子3上检测到G271A、C316A、G387T 3个SNP位点;还新发现4种双突变类型,分别是A99G和C150T、A99G和G115A、A99G和C316A、A99G和G387T。C171T位点仅存在与无角陶赛特群体中,为无角陶赛特特有的SNP位点;C316A、A99G+G115A和A99G+C316A位点为得克塞尔群体特有的SNP位点;G387T和A99G+G387T位点仅存在于滩羊群体,为滩羊群体特有的品种特性。2.各SNP位点及双突变位点在各群体中突变频率都较低,在滩羊群体中检测到的SNPs比较丰富。得克塞尔群体A99G位点和滩羊群体G271A位点的基因型频率偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),其他群体各位点基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。在A99G、C150T和A99G+C150T位点,不同品种之间基因型分布差异显著。3.绵羊外显子2、3共441 bp与山羊、水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡相应核苷酸序列同源性比较及ME、MP和NJ三种系统聚类方法构建的各物种间系统进化树结果一致:绵羊与山羊亲缘关系最近,遗传距离最小;而与水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡亲缘关系依次变远,同源性也依次降低,遗传距离亦随之增加。4.在影响生长发育性状指标的各因素中,品种效应占主导地位,品种与生长发育性状间存在极显著相关性(P<0.01),性别对生长发育性状影响不显著(P>0.05),各SNPs位点基因型对各生长发育性状指标影响不显著(P>0.05)。
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