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聚合育种是开展高产优质育种最重要的策略之一。SS1、SS2、Ghd7和Ghd8是位于不同染色体上的控制水稻源库性状的多效性主基因,其对水稻产量和源库的影响相对独立且各有特点。本研究利用携带SS2位点（有利基因来自特青）的Lemont近等基因系LE-SS2,携带SS1位点（有利基因来自Lemont）的特青近等基因系TQ-SS1以及珍汕97背景下分别携带Ghd7和Ghd8（有利基因来自明恢63）的近等基因系ZS97-Ghd7和ZS97-Ghd8,配置携带不同库源基因的杂交F2分离群体,通过MAS方法筛选聚合株系,分析不同基因聚合对库源的影响和效应,同时利用3K水稻种质资源开展上述多效性基因的有利单倍型鉴定试验。主要结果如下:1.通过MAS,鉴定到聚合有2个目的基因的纯合单株及亲本158株。F3代纯合株系的主要农艺性状调查结果表明,聚合株系间表型变异较为丰富。方差分析表明,相比聚合亲本,SS1与Ghd7聚合后显著增加了一次、二次枝梗数和每穗总粒数,导致单株产量显著增加;SS1与Ghd8聚合后显著增加了二次枝梗数、剑叶长宽、株高、单株有效穗数和每穗总粒数,延长了抽穗期,导致单株产量的极显著增加;Ghd7与Ghd8聚合后显著增加了一次枝梗数、单株有效穗数、千粒重,但降低了株高,导致单株产量的极显著增加。以上3组双基因聚合均增加了单株产量。另3组双基因聚合体的产量均显著降低或与亲本之一持平。具体地,SS2与Ghd7聚合后显著增加穗长,减少了一次枝梗数、增加了株高和单株有效穗数,降低了每穗总粒数和结实率,最终导致单株产量与亲本SS2持平,但显著低于亲本Ghd7;SS2与Ghd8聚合后显著增加了一次枝梗数和剑叶长,但显著减少了二次枝梗数和每穗总粒数,提早抽穗期,最终导致单株产量显著低于双亲;SS1与SS2聚合后显著增加了一次枝梗数,降低了株高和千粒重,延长了抽穗期,最终导致单株产量显著低于双亲。结果表明,不同高产基因聚合所产生不同的聚合效应存在差异,在聚合育种中要合理针对性地利用不同有利基因的聚合,上述结果中SS1分别与Ghd7、Ghd8以及Ghd7与Ghd8聚合后效应显著,后期有望选育出优异品系。2.SS1、SS2、Ghd7和Ghd8的优异单倍型鉴定。综合考虑起源地、不同group的多样性,从3000份种质资源材料中挑选出630份（来自58个不同国家或地区）的携带目的基因的单倍型材料,每个单倍型不少于10个品种,其中360份材料含有SS1基因包含16种单倍亚型,425个品种含有SS2基因,分为13种单倍型,445份材料含有Ghd7基因,包含20种单倍型,481份材料含有Ghd8基因,分为29种不同单倍型。表型鉴定分析表明,在深圳环境下,SS1的优异单倍型为hap6和hap10;SS2优异单倍型为hap5,hap6,hap11,hap12;Ghd7表现优异的单倍型有hap6、hap15、hap18;Ghd8基因的优异单倍型为hap1与hap11。