本研究以福建农林大学百竹园中竹亚科的30个属命名种为研究对象，从DNA多态性分析的ISSR分子标记方法着手，利用DNA分子标记技术系统的研究遗传背景十分复杂的竹子种质资源，对其遗传多样性、亲缘关系进行研究，开展种质资源的分子鉴定，并建立有效的DNA指纹图谱，同时研究竹子在园林上的应用。采用ISSR分子标记技术，对我国竹亚科30个属的命名种即：绿竹、短穗竹、业平竹、箬竹、寒竹、慈竹、牡竹、大节竹、瓜多竹、唐竹、酸竹、巨竹、矢竹、少穗竹、簕竹、刚竹、茶秆竹、梨竹、思劳竹、泰竹、泡竹、单枝竹、空竹、巴山木竹、镰序竹、倭竹、大明竹、箭竹、玉山竹、赤竹进行遗传多样性分析。实验研究竹亚科植物的DNA提取方法，研究竹类植物普遍适用的ISSR-PCR反应体系进行优化，筛选出18条条带清晰和稳定性较好的引物，使用Popgene32软件进行遗传多样性分析，获得遗传相似度和遗传距离的信息。用SPSS13.0软件，得出了30个竹种的ISSR树状聚类图。本实验得到结论如下：（1）采用单因素多水平梯度筛选法进行实验设计，对Mg2+、模板DNA、TaqDNA聚合酶、dNTPs、引物这5种因素进行体系优化，建立竹亚科30个属命名种的ISSR-PCR扩增体系，即20μl反应体系中模板DNA40ng，引物0.6μmol·L^-1，TaqDNA聚合酶1.0U，Mg2+2.5mmol/L，dNTPs0.25mmol·L^-1，1×buffer；并通过实验筛选得出相应引物的最佳退火温度。（2）从100条的ISSR随机引物中筛选出18条能够扩增出清晰的特异性条带的引物，对30个命名种进行遗传多样性的分析，一共扩增出253个清晰的位点，其中多态性位点有253个，占总位点的100%；每个引物平均扩增出14个位点，而多态性位点百分比都为100%。（3）30个竹种的多态性百分比变化范围在23.72％～44.27％之间。PPB最大的是箭竹，PPB最小的是绿竹，说明这两个群体间的适应能力差异性较大。其它竹种的多态性也都较高，30个竹种的遗传基础范围广，遗传多样性较丰富。（4）30个竹种的观测等位基因数（Na）为2.0000个，有效等位基因数（Ne）为1.5756个，Nei’s基因多样性指数（h）为0.3437，Shannon多样性指数（I）为0.5178，多态位点百分率（PPB，％）为100%，多态位点有253个，同时30个竹种间的遗传多样性Ht=0.3463。说明30个竹种的遗传多样性还是相当丰富，这为竹类植物多样性提供了分子基础。（5）利用软件Popgene32软件，分析30个命名种的遗传距离在之间0.104～0.6207，平均为0.4414，遗传距离最大0.6207，在9号瓜多竹和27号大明竹之间；遗传距离最小的是0.104，在28号箭竹和29玉山竹之间。（6）采用的DNA聚类分析结果和传统的分类很多地方比较吻合，在这次试验研究的竹种中，如传统分类中的刚竹亚族的竹种大节竹、唐竹、短穗竹、刚竹，具有较近亲缘关系，都聚集在第六组分类中；而且牡竹族的倭竹、业平竹、寒竹也都集中于第六组分类中；而遗传传距离最小的箭竹、玉山竹种也同时出现在第五组中；传统分类中的倭竹亚族：业平竹和寒竹也在实验结果出现于倭竹亚族中；梨竹族的竹种也集中在第二和第五组。该实验结果和传统分类结果基本吻合，由此可见，DNA分子标记用于分析竹种间的亲缘关系和遗传多样性，具有较高的精确性和可靠性，同时可以作为竹子分类的参考依据。（7）本实验使用的18个引物，即UBC810、UBC811、UBC825、UBC827、UBC835、UBC836、UBC841和UBC857引物都能独立构建基于ISSR-PCR30个属命名种的数字指纹识别码。（8）采用传统的方法分类，主要根据竹子外部显著的形态特征，采用二歧归类方法进行分类和命名，通俗易懂，直观，具有普遍适用性，产生时间较早。ISSR分子标记是一种完全不同于传统分类的方法，揭示30个竹种的内在联系，全面反映了竹种间遗传多样性。而且学术性强，针对性强，适用群体单一，分类的可靠性和准确性较高。ISSR分子标记分类法是一种新的识别技术手段，为竹子的研究开辟了新的道路。（9）本实验通过对竹子在园林造景方面的研究，从遗传多样性、美学特征、空间关系、运用形式、角色扮演、城市绿地等方面进行分析，将传统的造园“因地制宜，师法自然”的思想和现代的“生态、低碳”的设计理念巧妙的结合，注重因境置竹和生物多样性保护，扩宽竹子造景的视野，为竹子的园林运用开辟了新的途径。但是当前还需积极探索新的设计思想和造景手法，竹子造景要进一步发展，还是任重而道远的。