棉花是新疆主要的经济作物之一,也是新疆社会稳定和经济发展的重要影响因素之一。在新疆棉区,周期性热害经常发生,尤其在7、8月棉花盛花期、结铃期,严重影响产量和纤维品质。本研究对144份陆地棉材料的耐高温性、农艺性状、产量性状、品质性状及SSR分子数据进行遗传分析,得出以下结论:1、从参试的144份陆地棉种质材料耐高温性可以看出,新疆棉花种质耐高温性多为中耐高温及敏温材料,耐高温种质材料较少。本研究所选农艺性状能够较好的将不同耐高温性的棉花种质材料进行较合理的聚类。SSR标记聚类遗传相似系数为0.49～1.00,说明在分子水平上144份种质资源的遗传多样性较为丰富。2、从参试的144份材料中挑选20份材料进行光合生理性状分析,水分利用率、蒸腾速率、净光合速率、胞间CO2浓度等性状,在高温胁迫后存在显著性差异,气孔导度存在差异但不显著,不能作为耐高温品种筛选的光合性状。3、通过产量与光合性状的相关性分析,结果可知耐高温材料蕾铃脱落低、干蕾干铃少、成铃率高、净光合速率、胞间CO2浓度、气孔导度均较高。说明在高温胁迫环境下,耐高温材料仍能保持较高的光合作用能力,保证了棉花生长所需的光合有机物的供给,从而能有效降低蕾铃脱落,实现较高成铃率。4、研究发现和棉花产量密切相关的单株结铃和单铃重与净光合速率、蒸腾速率以及水分利用率呈正相关,结合产量结果分析,筛选出了中棉所35、湘棉11、鄂棉10号这3个耐高温性好的品种,为耐高温品种选育时,在选择亲本材料提供理论支持。5、标记出46个与棉花农艺性状、品质性状以及耐高温关联的SSR位点。其中35个SSR位点与农艺性状的相关联,11个SSR位点与品质性状的相关联。标记了 4个与棉花蕾铃脱落和花粉活力相关连的位点,所有SSR位点的表型变异的解释率为0.0021～0.0419。