小兴安岭地区野猪MHC-DRB第Ⅱ外显子与肠道线虫关系的研究

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Norazhongli
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
寄生虫可以在一定程度上威胁着野生动物的种群健康,例如:后圆线虫(Metastrongylus spp.)能引起呼吸道疾病,蛔虫(Ascaris spp.)能引起肠道机械损伤等。主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)在免疫反应中至关重要,同时在寄生虫抵抗中起着重要作用,猪的MHC也叫猪白细胞抗原(Swine Leukocyte Antigen,SLA),位于猪的7号染色体上,是研究适应性进化的最佳候选基因,虽然在家猪(Sus scrofa f.domestica)中已经有大量的研究,但在野猪(Sus scrofa)研究中仍处于初级阶段。因此,研究野猪的MHC基因与寄生虫的相互作用对野猪的保护至关重要,同时也为小兴安岭地区东北虎种群的恢复奠定了基础。为了深入了解其内在机制,我们于2018年12月至2019年3月进行小兴安岭的冬季样线调查时共收集到92份野猪粪便,并通过微卫星的方法进行个体识别。然后通过二代测序对每一只个体SLA-DRB基因进行遗传进化和多态性分析。此外,利用麦克马斯特计数法对野猪粪便虫卵的载荷量进行鉴定。最后通过线性模型(LM)的方法建立二者的关系,并检验了模型的预测概率。我们的结果如下:1.在小兴安岭92份野猪粪便中,共鉴定出4种寄生虫包括:猪后圆线虫(Metastrongylus elongatus)、猪蛔虫(Ascaris suum)、毛细线虫(Capillaria sp.)、猪鞭虫(Trichuris suis)。其中感染率最高的寄生虫是猪后圆线虫,感染率为42.67%。然后我们计算了每份野猪样本的α多样性指数(包括:Simpson物种多样性指数和Shannon-wiener物种多样性指数,Chao1物种丰富度指数)以及总寄生虫载荷量。最后,基于Bray-Curtis相异性分析了β多样性指数。然后通过Mann-Whitney U检验比较不同地区它们的差异。我们发现佳木斯的野猪种群总载荷量显著高于伊春(p=0.03),佳木斯地区β多样性指数显著高于其它地区,然而α物种多样性指数和Chao1物种丰富度指数在不同地区之间没有显著差异。2.在92份野猪粪便中共鉴定出了73只野猪个体,对73只个体的测序结果核酸序列分析和氨基酸序列分析发现:(1)73只野猪个体共检测出8个SLA-DRB等位基因,核苷酸多样性为0.075,单倍型多样性为0.937,平均核苷酸差异为17.71。(2)小兴安岭野猪SLA-DRB基因总位点和抗原结合位点(ABS)位点受到正向选择作用(d N/d S>1),非抗原结合位点(non-ABS)受到纯化选择作用(d N/d S<1),ABS位点的d N/d S通过Z检验发现p<0.05,表明自然选择对此区域野猪ABS的多态性有利。(3)对正向选择位点和负向选择位点进行预测,共发现2个负选择位点(第2位的苏氨酸和第43位的天冬氨酸),并未发现正选择位点。3.我们发现SLA-DRB*03基因与寄生虫的总载荷量、Chao1物种丰富度指数间存在显著的负反馈(p<0.05),其它SLA-DRB等位基因没有发现显著的影响,表明SLADRB*03基因可能为寄生虫的抗性基因。同时系统发育树分析结果表明,这个基因与家猪的DRB基因聚为了同一个分支,这可能是因为野猪和家猪寄生虫构成相似,因此进化出了相似的SLA-DRB基因。
其他文献
【目的】本研究基于试验测定的中国荷斯坦牛血液和乳汁中的孕酮浓度表型,探究了影响中国荷斯坦牛体内孕酮分泌的环境因素、孕酮浓度的变化趋势、孕酮浓度与乳成分的关联程度以及血乳中孕酮浓度的预测方法。【方法】试验于2021年8月在北京、山东两个牧场采集不同胎次、泌乳阶段和妊娠状态的中国荷斯坦泌乳牛的奶样、尾根血样,测定孕酮浓度,最终获得402条乳汁孕酮浓度和298条血液孕酮浓度表型用于数据分析。对孕酮浓度进
碳/玻混杂复合材料在工业应用中表现出巨大的应用潜力。基于红外热像法试验研究了碳/玻混杂复合材料层压板与2种非混杂材料低速冲击下的红外辐射特征。通过目视、超声C扫描和光学显微镜等方法确定冲击后层压板的损伤模式,分析热图序列的时序变化特征和温度分布特征,从而表征冲击过程中的热耗散效应。结果表明:红外热成像技术非常适合监测低速冲击下纤维增强复合材料的损伤过程,通过热图序列可以建立起监测特征与各损伤模式之
针对在高分辨率输电线路图像中,不同种类部件尺度跨越大,难以被均衡检测的问题,提出一种融合高效注意力的多尺度输电线路部件检测算法。首先在YOLO v5目标检测算法中,设计添加高效注意力模块ECBAM提高算法特征提取能力。其次根据输电线路部件的特征分布统计,使用滑动窗口对高分辨率输电线路图像进行切片,并对切片前后的图像分别使用改进后的YOLO v5算法训练模型。最后将两个模型的检测结果进行集成,得到多
为探索双香豆素(dicoumarin,DIC)抑制斜纹夜蛾Spodoptera litura卵巢细胞SL-221增殖及作用机制,首先,采用CCK-8法测定双香豆素等21个酚类化合物对SL-221细胞的毒性;其次,通过倒置显微镜观察4 μg/mL双香豆素处理细胞48 h后其形态变化,并结合流式细胞术研究双香豆素对SL-221的细胞周期、线粒体膜电位及凋亡的影响;最后,通过实时荧光定量PCR技术(RT
教学档案袋评价是凸显个性、尊重主体、重视教学过程以及多元评价主体参与、具有导向功能的一种发展性的教学评价。围绕教师个人发展规划、专业成长的轨迹、多元主体评价与教师反思,在高职院校引入教学档案袋评价,进行教学档案袋的创建、评价,能促进教师认识自我、反思成长,发展成为教学名师、学术带头人;同时有助树立榜样培养教师,组建教学团队共谋发展,是“以评促教、以评促改、以评促学”的一种新举措,能有效促进教师队伍
期刊
<正>连词是语篇(口语的和书面的)显形的衔接手段之一,人们关于连词的研究也不断深入,就目前来说,连词的研究"结合复句语义关系的分析比较详尽,结合单句、句组、篇章的分析相对粗略;表层形式的归纳和事理分析的描写仍然居多,深层关系的探索和逻辑、
会议
概述了国外有关连铸高速钢、工模具钢的工业化生产应用以及国内一些企业和研究机构围绕高碳高合金钢连铸技术做过的研究和工业试验。分析认为有必要加大高碳高合金钢连铸技术的开发和应用。相比于传统模铸,研究表明连铸可使粗大的碳化物厚度降低40%,晶粒尺寸降低50%,并且碳化物形貌也由平直片状转变为纤维状,这将有利于后续锻轧工艺的碳化物细化。最后提出了可在连铸矫直机、水冷工艺、铸坯截面尺寸以及成材锻压比方面进行
针对无人机遥感影像中可能出现的多个密集的小目标,在检测时会出现误检、漏检的难点问题,本文提出了一种基于YOLO v4的具有密集连接网络模块的遥感影像轻量化目标检测算法,实现了对无人机遥感影像中车辆小目标的高精度识别。首先,对YOLO v4主干网络CSP Darknet53的卷积层采用密集连接、稀疏连接两种处理方式,加强特征的提取和重复使用,以缓解梯度消失问题;然后,对此模块进行模型剪裁,减少网络层
[目的/意义]突发事件网络舆情群体极化形成和演化受到来自物理空间、社会空间、信息空间的诸多风险致因因素影响,群体极化风险识别是在对其演化机理全面梳理基础上,对是否产生风险的判断,是社会风险评估和管控的前导性环节。[方法/过程]文章论证了极端观点是群体极化风险存在的最主要具象形态,分析了极端观点的特征,构建了极端观点的TCMCR识别模型,基于自我归类理论中引用的原型性概念来识别极端观点,以元对比率的