随着化石燃料的大量消耗以及环境问题的不断增加,全球生物能源的重点已经从非可再生的石油型碳源转向农业和林业的副产品这些可再生的碳源。为了充分利用纤维素这一主要的可再生碳源,需要深入研究降解纤维素的相关酶。虽然对纤维素酶的研究和应用已经有很多年的历史,但相关的研究和应用中还存在着很大的问题。最主要的原因是对纤维素的降解机制、各个纤维素酶之间的协同机制以及纤维素酶本身的表达机制也没有确切的理论。所以对纤维素酶降解机制,协同机制以及表达机制相的关调控基因成为纤维素酶的研究热点。本文为了研究匍枝根霉纤维素酶表达相关的调控基因,提高匍枝根霉降解纤维素的能力,使用抑制性消减杂交技术(SSH),经过提取mRNA、反转录获得cDMNA、酶切消化、两轮杂交、两轮巢式PCR等一系列步骤后,成功构建了匍枝根霉纤维素酶系的三组表达差异正反向cDNA文库并对获得的表达序列标签(ESTs)进行了分析。本文取得了以下结果：(1)通过对葡萄糖、CMC和稻草三种不同发酵培养基单一氮源培养匍枝根霉的研究,最终确定了以KNO3为单一氮源时三种发酵培养基培养的匍枝根霉提取的总RNA质量最好。(2)通过对葡萄糖、CMC和稻草三种发酵培养基中匍枝根霉发酵时间的研究,最终确定了在葡萄糖培养基中匍枝根霉发酵36h,在CMC和稻草培养基中匍枝根霉发酵60h时,提取的总RNA质量最好。(3)通过使用抑制性消减杂交技术(SSH)成功构建了三组不同的正反向cDNA差异文库,获得了2000个阳性克隆,经过酶切验证,选出200个对其进行测序,获得66条不同的表达序列标签(ESTs)。(4)对已知功能的表达序列标签(ESTs)进行了分类分析,发现差异基因涉及到匍枝根霉中的不同代谢反应,包括应激反应、信号传导、能量代谢、转录调控、蛋白质合成加工、RNA加工等。Blastn分析发现,在纤维素酶表达调控中得到的这些差异基因可分为四类：结构基因,如5.8s,18s,28s RNA基因等,某些结构基因在不同培养基中的独特表达,是纤维素酶表达机制差异的原因；代谢途径,如p-1,3-纤维二糖酶,p-1,4-纤维二糖酶,NAD依赖性差向异构酶/脱水酶家族蛋白,1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶等,参与形成纤维素酶的能量代谢和物质代谢；细胞表面,如半纤维素α-1,2-甘露糖苷酶,肌动蛋白,鸟苷酸环化酶C型2等,参与了纤维素酶表达机制中基因表达的调控以及细胞结构的改变；功能不明的未知基因,它们在纤维素酶表达机制中的功能还有待探索。