白羽番鸭卵巢组织转录组及产蛋性状相关基因关联分析

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Linhan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
番鸭原产于中南美洲热带地区,引进中国后,主要在我国南方饲养较多。番鸭是优良的肉鸭品种,不仅具有肉质好、营养价值高、肉味鲜美等特点,还具有体重大、耐粗饲、饲料转化率高等优点。近年来,番鸭养殖逐渐受到重视,其饲养规模逐年增加,在养禽业中具有很高经济价值。由于番鸭产蛋率低、冬季休产时间长,并且未经过系统选育,群体产蛋性能差异较大,严重影响了番鸭产业的发展。因此,研究白羽番鸭的产蛋性状规律,以及与产蛋性能密切相关基因的遗传变异,为白羽番鸭早期科学选种选育奠定基础。本研究对28~51周龄白羽番鸭的产蛋率及累计产蛋量曲线进行拟合分析,揭示白羽番鸭的产蛋规律,根据产蛋规律可调整饲养方案,充分挖掘其产蛋潜力;对产蛋高峰期高产和低产白羽番鸭卵巢组织转录组测序分析,筛选出差异表达基因(DEGs),并探究DEGs的功能,为白羽番鸭分子育种提供理论依据;对白羽番鸭产蛋性状相关的基因GDF9、TGFB3和MTNR1A的SNP研究,筛选与白羽番鸭产蛋性状相关的有效分子标记位点,为优良高产白羽番鸭选种提供理论依据。研究结果如下:1.经过拟合白羽番鸭的周产蛋率及累计产蛋量曲线得出:本育种群白羽番鸭周产蛋率的最佳拟合模型是杨宁模型(y_t=0.913*exp(-0.037*t)/[1+exp(-0.856*(t-3.591))]);本育种群白羽番鸭累积产蛋量的最好拟合模型是Von Bertalanffy模型(y_t=103.384*[1-0.851*exp(-0.099*t)]~3),预测的拐点周龄为36.467周。2.通过对高产和低产白羽番鸭卵巢组织进行转录组测序分析,筛选出296个DEGs,与低产白羽番鸭相比,高产白羽番鸭卵巢中有160个基因上调,136个基因下调。133个DEGs获得GO功能注释,富集到492个GO Term中。DEGs的KEGG显著富集主要涉及的六个信号通路,其中的PI3K-Akt信号通路与动物繁殖有很大关系。实时荧光定量qPCR检测DEGs,高产白羽番鸭卵巢中POSTN、COL4A1、SMOC1、CPEB2和C1QTNF3的表达量相对于低产白羽番鸭显著上调(P<0.05),CEBPD表达量相对于低产白羽番鸭极显著上调(P<0.01),MC2R的表达量相对于低产白羽番鸭极显著下调(P<0.01),这与转录组结果一致。预测筛选出的差异表达基因POSTN、COL4A1、SMOC1和SDC4在PI3K-Akt信号通路中调控卵巢生理功能,预测CPEB2、C1QTNF3、CEBPD和MC2R基因的差异表达影响白羽番鸭卵巢生理功能。3.GDF9基因g.3340814 C/T与白羽番鸭280日龄产蛋数和300日龄产蛋数显著相关(P<0.05),与280日龄体重不相关(P>0.05);GDF9基因g.3341687 G/A与白羽番鸭的280日龄产蛋数、300日龄产蛋数和280日龄体重不相关(P>0.05)。TGFB3基因的4个SNP位点(g.27959496 G/A,g.27965097 G/A,g.27965604 C/T,g.27970706C/T)和MTNR1A基因的2个SNP位点(g.19463377 G/A,g.19463425 C/T)与白羽番鸭280日龄产蛋数、300日龄产蛋数和280日龄体重均不相关(P>0.05)。GDF9基因的多态位点可以作为白羽番鸭产蛋性状的有效分子标记。
其他文献
缺氧是许多疾病的诱因,因此溶解氧传感对某些疾病的诊断和治疗至关重要。本论文以光学分析法为基础,以疏水的五氟四苯基铂卟啉为氧敏感探针,以不同结构的两亲性聚合物为载体,制备了几种氧传感胶束用于生物溶解氧传感和成像。首先,通过原子转移自由基聚合法合成了五种结构不同的四臂两亲性聚合物,以探究聚合物结构和胶束性能的关系。结果显示,两亲性聚合物的疏水链越长,胶束的直径越小,包封率越小,临界胶束浓度越大。此外,
背景有机磷农药广泛用于农业,文献报道动脉粥样硬化的形成与其他心血管有关的疾病与长期低剂量接触有机磷可引起血管功能障碍。研究热点指向水胺硫磷对心血管功能的影响,但是作用机制尚不十分清楚。非晶态硒对水胺硫磷引起的血管功能损伤的影响尚未见文献报道,钠氢交换蛋白1(Na+-H+exchanger 1,NHE-1)在心血管疾病中的作用逐日引起广大研究学者的关注,本研究旨在观察NHE-1在非晶态硒(Amorp
汉语和英语都有状语这个句法成分,但是汉语的状语通常只能前置于谓语中心语,后置的被称为补语;英语的状语前置或者后置的情况都比较常见,但是统称为状语。因此状语往往成为英语为母语的汉语学习者容易出现偏误的语法点之一,同时这也是学习者学习汉语的一个难点。针对这一问题,本文基于“三个平面语法理论”,佐以“英汉对比理论”、“话题焦点理论”等理论,对汉英状语的位置进行系统地对比与研究。首先,对汉语状语和补语的情
目的:探讨肌动蛋白样6a(ACTL6a)在胆管癌中的表达及其与患者临床病理特征和预后的关系,观察其与上皮-间充质转化(EMT)的分子标志物E-cadherin,N-cadherin,Vimentin,β-catenin,Snail的表达变化的关系,探讨其在胆管癌上皮-间充质转化中的作用,为寻找胆管癌早期诊断分子标志物和药物治疗靶点提供策略,以期提高胆管癌的整体治疗水平,改善病人的预后。方法:收集5
随着可再生能源在电网中所占比重日益增大,越来越多的分布式微源被挂接于电网中。为了适应这种能源发展趋势,同时保证多种交流型和直流型负荷入网,针对交直流混合型微电网的
传粉资源减少(pollinator decline)日益成为全球关注的生态学焦点问题之一,深刻的影响着粮食安全和生态系统平衡。作为重要的传粉媒介,蜜蜂类昆虫对于依赖动物进行传粉的被子植物而言具有重要的作用,在生态系统的稳定和维持过程中发挥着不可替代的作用。肯尼亚Kakamega雨林区是东非重要的热带雨林生态系统,也是肯尼亚重要的农业种植区之一,依赖动物传粉的作物种类多样性程度很高;同时该地区也具有
本试验设置不同水平的低蛋白饲粮并补充过瘤胃保护氨基酸,研究氨基酸平衡模式下的低蛋白饲粮对杜寒杂交肉羊生长性能、屠宰性能、消化代谢性能和肉品质的影响。研究内容分为以下三个部分:试验一:研究低蛋白饲粮补充过瘤胃氨基酸对肉羊生长性能和屠宰性能的影响,旨在降低饲粮的粗蛋白质含量。选取平均体重为33 kg的育肥杜寒杂交肉用母羊150只,分成5组(每组3个重复,每个重复10只羊)。试验处理分别为:对照组饲喂粗
背景间充质干细胞(Mesenchymal stem cells,MSCs)因其具有多向分化潜能、免疫调控能力和内分泌功能等是目前在细胞治疗和再生医学领域有应用前景的干细胞之一。MSCs是由具有
目的本研究以胃俞募配穴调节功能性消化不良(Functional dyspepsia,FD)大鼠胃运动的中枢作用靶点和分子机制为切入点,通过观察电针对FD模型大鼠胃运动、原癌基因c-fos的表达的影响、海马区谷氨酸含量及N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体亚单位表达的变化,探讨海马参与电针胃俞募配穴调节FD模型大鼠胃运动协同效应的中枢作用靶点和分子机制。方法健康成年清洁级Sprague-Dawle
嘌呤作为自然界中的一类重要化合物,其结构主要由嘧啶环和咪唑环稠合而成,是天然杂环化合物中分布最广的一类含氮杂环化合物。嘌呤类衍生物可以与大量酶或受体发生作用,从而参与到各种生命活动中,因此而具有广泛的生物活性。嘌呤类衍生物的这一特点使它们被广泛应用于医药行业,例如抗肿瘤,抗病毒,抗炎症,抗菌,抗哮喘及免疫增强剂等等。其中嘌呤类化合物应用于抗肿瘤药物已由很长的历史。从早期巯嘌呤类抗代谢物开始发展至今