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TLR-IL-1R(TIR)超家族成员在介导免疫反应中具有非常重要的作用,其共同特点是胞内区都含有一个TIR保守结构域。TIR超家族主要分为两个亚群:一个亚群是胞外区富含亮氨酸重复序列(LRR)的受体,即Toll样受体亚家族;另一个是胞外区含有免疫球蛋白(Ig)结构域的受体,即IL-1受体亚家族;第三个亚群由信号通路下游接头分子组成,即MyD88亚家族。TLR1和SIGRR都是。TIR超家族的成员,分别属于TIR家族的Toll样受体亚家族和IL-1受体亚家族。TLR1是TLR家族的重要成员之一,属于病原相关分子模式(PAMP)识别受体,TLR1可与TLR2形成异源二聚体从而识别三酰基脂肽和真菌的一些产物。DIGIRR是哺乳动物SIGIRR的同源体,是TIR超家族中新发现的成员,属于孤儿受体,目前认为SIGIRR主要在TIR超家族成员信号通路中起负调控作用。本研究在河豚中成功克隆了2个新基因,TLR1基因(TnTLR1)和DIGIRR基因(TnDIGIRR)。
TnTLR1 cDNA序列长2587bp,其中5’URT长122bp,3’UTR长74bp,ORF长2391bp。TnTLR1基因编码由796个氨基酸组成、分子量为90.69kDa、p,为8.43的多肽。在TnTLR1多肽序列上存在多个潜在活性位点,包括13个蛋白激酶C磷酸化位点,9个N端糖基化位点,1个细胞黏附序列,3个酪氨酸激酶磷酸化位点,13个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,4个十四酰基化位点。TnTLR1具有LRR结构域受体亚家族的共同特征,胞外区582个氨基酸,包括5个LRR结构域;胞内区157个氨基酸,具有典型的TLR结构域;此外,还具有57个氨基酸的跨膜区和长23个氨基酸的信号肽序列。TnTLR1在正常组织中为组成性表达,LPS诱导并不能显著改变TnTLR1在这些组织中的表达量。序列比对显示TnTLR1与其它物种TLR1s之间有较高的氨基酸相似性,说明TLR1s在进化中具有高度的保守性。进化树分析表明鱼类TLR1s基因很有可能是哺乳动物TLR1、TLR6和TLR10基因在进化过程中的共同祖先,为研究鱼类TLR1s在进化和免疫反应中的作用打下了基础。
TnDGIRR cDNA序列长1916bp,其中5’UTR长112bp,3’UTR长229bp,ORF长1575bp。’TnDIGIRR基因编码由524个氨基酸组成、分子量为58.05kDa、P为6.54的多肽。在TnDIGIRR多肽序列上的潜在活性位点包括6个蛋白激酶C磷酸化位点,7个N端糖基化位点,8个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个十四酰基化位点。TnDIGIRR同样具有Ig结构域受体亚家族的共同特征,胞外区236个氨基酸,包括两个Ig结构域;胞内区272个氨基酸,具有典型的TIR结构域;此外,还具有16个氨基酸的跨膜区和长16个氨基酸的信号肽序列。TnDIGIRR在健康鱼所选组织中为非组成性表达,心脏、脑、皮肤和肝脏表达量较高,鳃和肠组织中表达量稍低,而在肌肉中不表达。基因结构分析、多序列比对和进化树分析都表明,鱼类DIGIRR有其特殊性,主要表现在胞外区带有一段信号肽,与哺乳动物中对TLRs信号通路起负调控作用的SIGIRR结构不同,含有两个Ig域,提示鱼类DIGIRR胞外区很可能有接收信号的功能;另一方面,鱼类DIGIRR胞内TIR结构域中对信号转导起关键作用的两个氨基酸残基只突变了一个,这种胞内区保留的IL-1R类似结构提示鱼类DIGIRR也存在信号转导的功能。总之,DIGIRR胞内和胞外结构所存在的特殊性,为鱼类DIGIRR在功能特异性的研究提供了一定的线索。