阿维链霉菌中γ-丁酸内酯受体同源蛋白AvaR2和AvaR1的调控机制

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:danNyZ
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阿维链霉菌(Streptomyces avermitilis)是重要的工业微生物,其产生的阿维菌素(Avermectins)由于具有高效、广谱和低毒的杀虫活性被广泛应用于农业、畜牧业和医药领域。在阿维链霉菌中,诱导阿维菌素合成的自调节因子信号-avenolide是一种新型的γ-丁烯酰类的小分子,而非常见的γ-丁酸内酯(GBL)类自调节因子。为了阐明阿维菌素生物合成的调控机制,本论文针对阿维链霉菌中两个GBL受体同源蛋白AvaR2和AvaR1的调控功能和作用机制进行了研究。阿维链霉菌中存在三个属于TetR家族转录调控因子的GBL受体同源蛋白:AvaR1(SAV3705)、AvaR2(SAV3702)和AvaR3(SAV3703),其中AvaR2与假GBL受体同源性最高。对avaR2进行缺失、回补和过表达,通过摇瓶发酵和形态观察实验,初步证实AvaR2负调控阿维菌素的生物合成和阿维链霉菌的生长,但不影响形态分化。进一步通过qRT-PCR、EMSA、DNase I footprinting、5’ RACE和ChIP-qPCR等实验,证实AvaR2能直接负调控aveR(阿维菌素生物合成的途径特异性正调控基因)、aco(avenolide关键合成酶基因)、自身基因以及其它两个avaR基因和avaR1和avaR3)的转录,并且与aveRp的亲和力最高。通过分析AvaR2在这5个启动子区的结合序列,得出其结合的一段保守的 18 bp不完全回文序列(AWWCCRBBHDDNMSGTWT.W:A或T:R:A或G:B:G、C或T;H:A、C或T;D:A、G或T;M:A或C;S:G或C;N:A、G、C或T)。利用该保守序列预测了一些新的AvaR2靶基因,并通过EMSA和qRT-PCR鉴定了 11个新的靶基因,它们分别参与初级代谢、核糖体蛋白合成、胁迫响应等生理过程,表明AvaR2是一个多效调控因子。AvaR2不仅能以内源的avenolide为配体,还能以外源的杰多霉素B(JadB)、安普霉素(Apr)和潮霉素B(HygB)作为配体调节其结合DNA的能力,表明AvaR2介导的信号传导系统不仅在种内而且在种间信息交流中发挥了重要作用。AvaR1与真GBL受体同源性最高。对avaR1进行缺失、回补和过表达,通过摇瓶发酵和形态观察实验,初步证实AvaR1负调控阿维菌素的生物合成,但不影响阿维链霉菌的生长和形态分化。进一步通过qRT-PCR、EMSA、DNase I footprinting和ChIP-qPCR等实验,证实AvaR1能直接负调控aveR、aco、自身基因以及其它两个avaR基因(avaR2和avaR3)的转录,并且与avaR3p的亲和力稍高。AvaR1与AvaR2在aveR、aco、avaR1、vaaR2和avaR3启动子区的保护位点相同,据此得出AvaR1和AvaR2结合的保守序列相同。通过EMSA和qRT-PCR鉴定了10个新的AvaR1靶基因,这些基因分别参与初级代谢、核糖体蛋白合成、胁迫响应、核酸代谢等生理过程,表明AvaR1也是一个多效调控因子。AvaR1和AvaR2既有共同的靶基因,也有各自不同的靶基因,表明它们可交叉调控不同的生理过程。
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