【摘 要】
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【目的】本研究的目的是为了构建出用于评估宫颈癌患者预后的风险模型,该模型基于自噬相关长链非编码RNA,并探索在宫颈癌中该模型与免疫浸润之间的关系。【方法】UCSC Xena提供了宫颈癌患者的RNA测序以及临床资料,自噬相关基因来自人类自噬数据库数据库。根据长链非编码RNA与自噬相关基因的共表达网络来鉴定与自噬相关的长链非编码RNA。之后利用Cox回归分析及套索回归分析得到目标长链非编码RNA并计算
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【目的】本研究的目的是为了构建出用于评估宫颈癌患者预后的风险模型,该模型基于自噬相关长链非编码RNA,并探索在宫颈癌中该模型与免疫浸润之间的关系。【方法】UCSC Xena提供了宫颈癌患者的RNA测序以及临床资料,自噬相关基因来自人类自噬数据库数据库。根据长链非编码RNA与自噬相关基因的共表达网络来鉴定与自噬相关的长链非编码RNA。之后利用Cox回归分析及套索回归分析得到目标长链非编码RNA并计算出风险评分,根据中位数风险评分将CESC患者分为高低危两组进行生存分析,并建立基于目标长链非编码RNA的预后风险模型。采用时间依赖性的受试者工作特征曲线、决策曲线分析及校准曲线等方法来评估该模型对患者预后的预测能力。之后使用多变量Cox回归分析与预后相关的独立影响因子,同时,还分析了风险评分与治疗结果和病理分型是否相关。利用基因富集分析来识别与预后评估模型相关的潜在通路。同时使用“x Cell”算法和ss GSEA来阐明宫颈癌中免疫细胞浸润和自噬相关长链非编码RNA表达之间的相关性。其次,根据GDSC数据库,预测了宫颈癌患者对治疗药物的敏感性反应。最后,利用q RT-PCR检测目标长链非编码RNA在宫颈鳞癌及腺癌细胞株中的表达情况。【结果】1.筛选出了3种ARLs（SMURF2P1、MIR9-3HG和AC005332.4）,并以此为基础构建出预后风险评估模型。2.使用Cox回归分析计算出的风险评分是可以评估预后的独立影响因素（HR=2.82,95%CI=1.87-4.30;p＜0.001）。3.基因富集分析探索出与预后评估模型相关的潜在通路,共获得了6条相关通路。4.“x Cell”算法和ss GSEA结果显示,激活CD8+T细胞（p=2.07 e-02）、内皮细胞（p=1.48 e-02）和前体脂肪细胞（p=3.14 e-03）在高危组中的比例显著增加。5.在两组中,有10种治疗药物的半抑制浓度有显著差异。6.通过q RT-PCR结果发现SMURF2P1属于促癌基因,可能在宫颈腺癌的发生发展中具有更大的作用。MIR9-3HG和AC005332.4属于抑癌基因,它们可能在宫颈鳞状细胞癌中发挥更为积极的作用。【结论】基于3种与自噬相关lnc RNAs（SMURF2P1、MIR9-3HG和AC005332.4）的预后风险评估模型能够有效的预测患者预后。SMURF2P1属于促癌基因,可能在宫颈腺癌的发生发展中具有更大的作用。MIR9-3HG和AC005332.4属于抑癌基因,它们可能在宫颈鳞状细胞癌中发挥更为积极的作用。其中,MIR9-3HG虽然在肿瘤中高表达,但它是一种保护性基因。在免疫浸润方面,CD8+Tem可能在CESC患者发挥免疫作用,抑制肿瘤远处转移。虽然CD8+Tem的免疫浸润水平与MIR9-3HG的表达呈负相关,但仍显示出CD8+Tem的保护作用。然而,CD8+Tcm可能有促进肿瘤转移的作用。
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