基于铁自噬相关基因的胰腺导管腺癌预后模型的构建

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dangyuanq4
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目的:本研究的目的是通过生物信息学分析来确定胰腺癌中铁自噬相关基因的预后意义。方法:针对这一问题,采用最小绝对收缩与选择算子模型(LASSO)方法建立了胰腺癌铁自噬相关基因的预后模型。对癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)数据集中的胰腺癌患者根据中位数风险评分进一步分为两组:低危组和高危组。采用R软件(版本4.1.2)、Cytoscape(版本3.9.1)、STRING数据库、人类蛋白图谱(HPA)等进行综合生物信息学分析,探讨胰腺腺癌(PAAD)中铁自噬相关基因成员的预后价值。结果:共有 8 个基因(ALOX15、ATG16L1、ATG7、BCAT2、CYB561A3、SNCA、TNF、FBXW7)在LASSO回归模型中,功能富集分析揭示了细胞对氧化应激的反应、对氧化应激反应的调节、自噬相关的生物学过程和信号通路。采用STRING数据库对8个铁自噬预后相关基因的蛋白-蛋白相互作用进行分析。Cox回归分析显示,在临床胰腺癌患者中,BCAT2的高表达水平和SNCA的高表达水平与预后好显著相关。结论:综上所述,生物信息学功能分析表明铁自噬相关预后基因对胰腺癌患者具有良好的预后价值,我们的结论可能揭示胰腺癌的发生机制,为胰腺癌治疗提供新的策略和思路。
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