党代表人民根本利益是重大的理论问题和实践问题。党代表人民根本利益是中国共产党性质、宗旨等本质属性的集中体现，关乎“立党之本、执政之基、力量之源”；也是一个复杂的系统，需要在实践中不断完善。江泽民“三个代表”思想科学地指出了巩固党的执政地位与代表人民根本利益的互动关系，并突出地强调了新世纪党如何代表人民根本利益的这一重大命题。本文仅围绕“怎样代表”这个问题，以马克思主义原理为指导，运用社会学、政治学、经济学、系统论等理论，对新世纪党代表人民根本利益的意义和所遇到的新情况、新问题进行理论分析，初步探讨了在新世纪党如何“提高代表水平”、进一步解决“代表什么样的利益”及“代表谁的利益”等由新的实践所提出的三个基本问题，并在此基础上提出了更好地代表人民根本利益的基本思路。全文共分三个部分。 第一部分论述了新世纪党代表人民根本利益的重大理论意义和实践意义。通过对党代表人民根本利益内涵和外延两方面的深入剖析、在党的建设中重要地位及其重大的现实意义的揭示，说明了这个命题的理论依据和现实价值，并概略地回答了党“为什么是”人民根本利益的代表问题。本文认为，党代表人民根本利益的实质是：保持党的本质（性质、先进性、宗旨、根本任务等内在规定的总和），始终走在时代前列，完善“代表”方式，提高“代表”水平，领导和支持人民群众推动有中国特色社会主义现代化建设事业不断向前发展。 第二部分论述了新世纪党代表人民根本利益所面临的新情况、新问题。具体分析了党群关系所面临的两大新情况，即人民群众在政治、经济、文化、安全需求上的新变化和国内社会阶级阶层、利益的新变化，说明了党代表人民根本利益必须进一步解决好“代表什么样的利益”和“代表谁的利益”两大基本问题；并通过对党的自身建设所存在的新问题，即如何提高执政能力和执政水平、党能否克服自身的消极腐败现象及党能否完善运行机制等三方面的分析，说明了党代表人民根本利益必须进一步提高“代表”水平的问题。 第三部分论述了新世纪党更好地代表人民根本利益的基本思路。这里初步探讨了解决“怎么代表”的可能性条件问题。提出了“增大社会利益”---加快有中国特色社会主义现代化建设步伐、“合理分配利益”---正确处理人民内部矛盾及“提高代表水平”---加强党的建设和改善党的领导的基本思路，并分别从宏观和微观、实质和形式、结构和功能相结合的角度论证了新世纪党更好地代表人民根本利益的客观条件、前提条件和主观条件。