最近几年,我国对国家经济产业结构进行了较大的调整,以及国内客户对货物运输质量、运输服务、运输价格和时间都有了更高的要求,这些都使集装箱适箱量增加,长江集装箱运输的优越性越来越明显。国家“十二五规划”,更是鼓励大力发展长江黄金水道。在后危机时代下,我国最具活力的经济地区之一就是长江经济带。国内巨大的市场潜力,越来越多的集装箱货通过长江进行中转,因而我国长江集装箱内支线运输呈现出一幅生机勃勃的画面。然而我国长江集装箱内支线运输蓬勃发展、支线集装箱码头建设新月异、港口内支线吞吐量不断增加的同时长江集装箱内支线运输企业的运营效益却不高,甚至有些企业处于无利或微利的境地。因此,针对长江集装箱内支线运输运营存在的问题,总结出长江集装箱内支线运输运营的几种模式,并对这几种模式进行评价,从而来提高整个长江集装箱内支线的运营效率是有必要的。目前,参与到长江集装箱内支线运输的企业众多。不同经济类型、不同经营规模、不同经营管理水平的经营者大批进入到长江集装箱内支线运输市场。像国有大型航运企业有中远集团和中海集团；一些货代企业也在租船经营内支线；部分港口企业、地方航运企业和民营企业也积极发展长江集装箱内支线运输；越来越多的个体和私营船主,也通过不同方式取得了内支线经营资格。服务水准的参差不齐、水准偏低。本文通过实地调研和网上查阅的方式收集长江集装箱内支线运输运营的资料和数据,了解不同类型的长江集装箱内支线运输企业经营现状,并根据长江上游、长江中游、长江下游分段进行运营现状分析,从而总结出长江集装箱内支线运输运营存在的问题；然后就长江流域经济、相关政策法规、长江航运基础条件(包括航道基础条件、集装箱码头基础条件)、长江集装箱内支线运输市场四个方面对长江集装箱内支线运输运营产生的影响进行分析；接着结合企业运营理论,总结出长江集装箱内支线运输运营的三种模式：干线-支线经营模式、公共承运人经营模式及物流联盟模式,并对这三种运营模式进行优劣分析；随后运用主成分分析法,提出评价模型,并进行长江集装箱内支线运输运营模式评价；之后利用SPSS统计软件和MATLAB程序,进行实例研究；最后提出长江集装箱内支线运输运营的建议、结论及展望。