农业是我国的第一产业,对我国国民经济的发展以及世界粮食安全问题的解决起着举足轻重的作用,而农业上市公司作为我国农业的龙头企业,代表我国农业的先进生产力,国家在税收、信贷、出口方面也给予了各种优惠政策,但农业上市公司的业绩与其他行业相比还有一定差距。从代理理论可知,股东与高管之间的契约是不完全的,双方利益存在不一致性和信息的不对称,使得股东对高管更难以监督。实施内部控制即可以约束高管的自利行为,这种条件下可以提升公司的业绩,解决代理理论中股东的问题。而高管作为核心人才,尤其是在缺乏人才的农业行业,必然会要求将自己的薪酬与公司的业绩挂钩,这样才能获得由于内部控制而失去的利益,弥补自己的损失。因此,本文提出了内部控制与高管薪酬业绩敏感性有正相关性,在学习和了解了相关文献和理论基础之后,选取了农业上市公司2007-2010年的年报数据作为本文的研究样本,运用了描述性统计方法和多元线性回归方法,验证了内部控制的自我评估报告和外部鉴证报告与高管薪酬之间的关系。最后得出结论：公司业绩越好,高管薪酬也会相应增加,成正相关性；内部控制质量与高管薪酬业绩的敏感度成正相关性,而且,与非国有控股的农业上市公司相比较,国有控股农业上市公司内部控制质量越好,薪酬业绩敏感度就更加显著；加大公司规模也可以提高高管薪酬。本文将高管薪酬与内部控制相联系,研究两者的相关性,为我国制定高管人员的薪酬提供了理论基础；根据以上分析得出的结论,又提出了有关农业上市公司内部控制建设和高管薪酬机制改善方面的建议。