【摘 要】
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目的了解福州市病毒性急性呼吸道感染（acute respiratory infection,ARI）病原谱及其流行特征,为疾病防控提供理论依据;了解ARI病例主要病原——呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）的基因特征,为疫苗、药物的研制提供一定信息。方法1.收集2018-2020年福州市三家不同类型医院的ARI病例信息并采集呼吸道标本,采用实时定量荧光P
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目的了解福州市病毒性急性呼吸道感染（acute respiratory infection,ARI）病原谱及其流行特征,为疾病防控提供理论依据;了解ARI病例主要病原——呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）的基因特征,为疫苗、药物的研制提供一定信息。方法1.收集2018-2020年福州市三家不同类型医院的ARI病例信息并采集呼吸道标本,采用实时定量荧光PCR（Polymerase Chain Reaction,PCR）或RT-PCR（Reverse Transcription-PCR,RT-PCR）法对标本进行15种病毒核酸检测,包括腺病毒（adenovirus,Ad V）、博卡病毒（human bocavirus,HBo V）、甲型、乙型流感病毒（influenza virus A/B,IFV-A/B）、呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）、副流感病毒1～4型（parainfluenza virus 1～4,PIV-1～4）、偏肺病毒（human metapneumovirus,Hmp V）、冠状病毒（coronavirus,Co V）-229E/OC43/HKU1/NL63、鼻病毒（rhinovirus,RV）的检测,应用卡方检验、Fisher精确检验分析ARI病例流行病学特征。2.使用RT-PCR方法扩增获取RSV核酸检测阳性病例样本G基因及全基因组片段并进行序列测定,对病毒序列进行遗传进化分析及核苷酸、氨基酸同源性分析,观察疫苗与药物研制的重要靶点是否有氨基酸突变的发生。结果1.2018年7月-2020年1月共收集到ARI病例1061例,共有424例病毒核酸检出阳性（39.96%）;2.研究期间不同年份福州的急性呼吸道感染病例主要流行的病毒病原体较为一致,包括RV、Ad V、RSV,其余病原体中,2018年下半年与2020年1月福州ARI病例的主要病原体为IFV-A,2019年则主要是Hmp V、PIV两类副黏病毒,而Co Vs、PIV-4在较少检出;RV（χ2=7.99,P=0.01）、Ad V（χ2=5.21,P=0.02）的感染存在性别差异,RSV、RV、Ad V在儿童中的检出率更高,多种病毒存在季节性分布;4.研究期间共收集到72例RSV病毒核酸检测阳性病例,通过PCR扩增获得53条G基因序列,NCBI Blast结果显示均为ON1、BA11,前期以ON1流行为主,进入2019年秋冬季后以BA11为主。5.ON1基因型（40例）序列间核苷酸相似性（95.3%～99.8%）、核苷酸相似性（92.5%～100%）以及BA11基因型（13例）序列间核苷酸相似性（97.3%～99.6%）、氨基酸相似性（94.8%～99.7%）均较高,与ON1原型（JN257693）、BA11原型（AY333364）相比未发现核苷酸的插入或者缺失,相似性均较高。6.共获得17条RSV全基因组序列,10例为ON1,7例为BA11,本地检出的病例与参考株相比核苷酸、氨基酸同源性较高,G蛋白上疫苗、药物研制的重要靶点未发现氨基酸突变,F蛋白在抗原位点、表位上出现了一定突变。结论2018年7月-2021年1月福州市急性呼吸道感染病例中病毒为重要病原体,主要流行的病毒包括RV、Ad V、RSV、IFV-A等,其余病毒病原体的流行存在更替现象;研究期间在福州收集到的RSV病例流行的型别为为ON1、BA11（73例中共53例获得明确分型信息）;17例获得全基因组序列（10例为ON1,7例为BA11）,获得的同型别序列间及与原型的相似性均较高,F蛋白在抗原位点、表位出现了一定氨基酸突变。
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