黄瓜花叶病毒卫星RNA的结构及其功能

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黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)携带卫星 RNA(satRNA)是一种普遍的生物学现象。卫星RNA侵染CMV通常会降低CMV的积累,从而减轻病毒的症状。然而,satRNA的致弱机制仍有待阐明。CMV satRNA是一类非编码RNA,其必须依赖于自身结构而行使其生物学活性。尽管已有文献预测了多个CMV satRNA分离物的二级结构,但尚未有生物学意义的二级结构被证实。本研究发现CMV satRNA T1分离物(sat-T1)能减轻CMV在本氏烟植物上引起的病毒症状,并选择性地降低编码病毒复制酶的C.MVRNA1和RNA2的积累水平。反式复制系统的实验结果表明,sat-T1降低CMVRNA1和RNA2的积累是由于sat-T1抑制CMV RNA1和RNA2复制的结果。我们通过RNA结构的预测和功能分析,测定复制竞争的结构基础是sat-T1的三向分支结构(Three way-branched structure)。该结构包括2个具有生物学意义的发夹结构,一个是复制竞争所必需的,另一个参与对sat-T1生存至关重要的假结结构的形成。含有假结的这个二级结构定义为γ形状的结构(γ-shaped structure,γSS),是CMV satRNA中发现的第一个与生物学表型相关的RNA元件。最后,我们提出了一个satRNA下调CMV积累和症状表达的模型,即通过γSS与辅助病毒中编码的复制酶的RNA竞争复制所需的宿主因子而实现CMV积累和症状表达的下调。综上所述,本论文首次报道了 CMV satRNA中具有生物学意义的二级结构和假结结构,同时揭示了 satRNA下调病毒症状和病毒积累的结构基础。在此基础上,我们提出了 satRNA下调CMV积累和症状表达的模型,为深入研究satRNA与辅助病毒的复制竞争奠定了理论基础。
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