【摘 要】
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目的:非编码RNA在妊娠高血压疾病的易感基因与小分子药物预测中发挥越来越重要的作用。通过研究妊娠期高血压期患者胎盘组织差异长链非编码RNA(LncRNA)及mRNA表达谱,探讨LncRNA及其靶基因的作用机制,为临床诊断和治疗提供理论依据。方法:选取2018年5月-2019年5月在潍坊市三甲医院治疗并足月分娩的30例妊娠期高血压患者胎盘组织作为实验组,另取同期在本院健康产检并足月分娩30例孕妇的胎
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目的:非编码RNA在妊娠高血压疾病的易感基因与小分子药物预测中发挥越来越重要的作用。通过研究妊娠期高血压期患者胎盘组织差异长链非编码RNA(LncRNA)及mRNA表达谱,探讨LncRNA及其靶基因的作用机制,为临床诊断和治疗提供理论依据。方法:选取2018年5月-2019年5月在潍坊市三甲医院治疗并足月分娩的30例妊娠期高血压患者胎盘组织作为实验组,另取同期在本院健康产检并足月分娩30例孕妇的胎盘组织作为对照组,取两组胎盘组织进行RNA测序;通过RNA-seq筛选差异LncRNA及mRNA,利用数据库进行差异LncRNA的靶基因预测;利用cluster profiler进行Gene ontology(GO)与KEGG分析,富集分别对靶基因的生物学功能及富集的信号通路;利用STRING在线数据库及Cytoscape软件进行蛋白质-蛋白质互作网络构建LncRNA-miRNA-mRNA网络及差异表达mRNA-小分子药物关联预测分析。结果:(1)通过对两组数据分析获得了19个妊娠高血压相关的差异LncRNA(4个上调LncRNA,15个下调LncRNA),差异表达mRNA共有423个(84个上调mRNA,339个下调mRNA)。(2)通过GO与KEGG富集分析发现:妊娠期高血压与内皮细胞损伤、炎症反应、免疫调节功能异常、滋养细胞侵袭异常等有关。(3)通过构建PPI网络和LncRNA-miRNA-mRNA网络,发现2个显著富集子网络模块:module-A(score=15)含15个节点,105个互作关系对;module-B(score=10)含17个节点,117个互作关系对,Linc01128在网络中调控的miRNA及mRNA最多,在网络中具有核心作用;(4)差异表达基因-药物小分子预测结果发现有19对差异基因与小分子药物存在对应关系,主要包括抗体、抑制剂、拮抗剂等关系。结论:妊高症患者胎盘中差异表达的LncRNA可通过靶向调控其靶基因参与调控多种免疫炎症相关生物学功能及相关信号通路,在妊高症发生发展过程发挥重要作用,预测的小分子药物可作为临床治疗的参考依据。
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