炭疽病是全球性的重要植物病害之一,尤其是在热带、亚热带的温暖潮湿环境条件下,容易为害各种经济作物,造成严重的经济损失,威胁粮食安全。炭疽病的病原菌为炭疽菌属(Colletotrichum)真菌,但炭疽菌还可以内生真菌的形式存在于植物体内。炭疽菌种类繁多,其分类一直处于比较混乱的状态,近年来,DNA条形码和分子系统发育学的发展,为炭疽菌属的准确鉴定和分类提供了很好的方法和手段。本研究在前人研究的基础上,对福建省多种经济作物上的炭疽菌做了系统研究,共采集了福建省10个不同地方28种经济作物的炭疽病样品,包括茶叶、柑橘、荔枝、辣椒、芒果等寄主的叶、茎秆或果实,共分离得到55个炭疽菌菌株。采用形态学观察(纯培养特征及孢子形态)和多基因(核糖体内转录间隔区(ITS)、β-微管蛋白基因(TUB2)、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、肌动蛋白基因(ACT)、钙调蛋白基因(CAL)、过氧化物酶体基因(SOD2)、几丁质合成酶(CHS-1))系统发育分析相结合的方法,对这些菌株进行鉴定,明确福建地区炭疽菌的主要类群、多样性及其亲缘关系。分离到的55株菌株鉴定为炭疽菌的9个种,分属于5个不同的炭疽菌复合种,分别是胶孢炭疽菌复合种(C.gloeosporioides complex)下的胶孢炭疽菌(C.gloeosporioides)、香蕉炭疽菌(C.musae)、果生炭疽菌(C.fructicola)和暹逻炭疽菌(C.siamense),博宁炭疽菌复合种(C.boninense complex)下的喀斯特炭疽菌(C.karstii),C.gigasporum复合种下的C.gigasporum,尖孢炭疽菌复合种(C.acutatum complex)下的松针炭疽菌(C.fioriniae)和斯科维尔炭疽菌(C.scovillei),以及禾生炭疽菌复合种(C.graminicola complex)下的牛筋草炭疽菌(C.eleusines)。本研究对这9个种进行了形态学特征的描述,并跟已有的报道进行了讨论。从八角金盘分离到的菌株经系统发育学分析和形态学特征分析确定为喀斯特炭疽菌(C.karstii),该种为八角金盘上的新记录种。同样,从黄瓜叶片、柠檬上分离到的菌株为暹逻炭疽菌(C.siamense),也是这两种植物上的新纪录种。从柚子叶片上分离到的果生炭疽菌疑似为柚子叶片的新记录种。此外,经过对这55个菌株的7个基因的系统发育分析发现,ITS基因都不能区分这5个复合种下的种,除此之外GAPDH、ACT基因也不能很好地区分。其中,对于胶孢复合种,只有以CAL基因建立的系统发育树自引导值和后验概率较高;尖孢复合种,以CHS基因建立的系统发育树自引导值和后验概率较高;博宁炭疽菌复合种,效果最好的为TUB2、ACT基因,与前两种复合种情况相反。因此在分析炭疽菌不同复合种时选的基因有所不同。本研究还从寄主、分离组织等方面探讨了福建地区炭疽菌的多样性。从鉴定结果来看,优势种为胶孢炭疽菌复合种的暹逻炭疽菌(C.siamense)和果生炭疽菌(C.fructicola),各占菌株总数的的30.9%(17株)、21.8%(12株),而暹逻炭疽菌(C.siamense)从12科16种的单子叶植物及双子叶植物上都有分离到,果生炭疽菌(C.fructicoal)从10种植物上都可分离得到。本研究中的炭疽菌大部分都是从叶片上分离得到,也进一步说明了炭疽病是重要的叶部病害。本研究的结果可为进一步研究炭疽菌的生物学特性等以及福建地区炭疽病的防治提供理论依据。