1994年的分税制财政体制改革使得中央政府和省政府之间的财政分配关系得到了进一步的规范，但这一改革却没有理顺省与市、县之间的分配关系。随着市管县财政体制的弊端逐渐显露，同时县乡等基层财政困难的现象在全国范围内频频发生，并且得不到有效的缓解，这一现象的出现使得县、乡等基层财政困难成为了社会热点，备受社会关注。近年来，在缓解县级财政困境的对策上，政府采取政府层级改革的措施，主要包括财政上的“省直管县”和经济管理上的“强县扩权”。这一改革已经成为我国地方财政体制改革的热点，改革的初衷也是为了缓解基层财政困境和发展县域经济，那么政府层级改革对县级财政困境的影响如何？基层财政困境应该如何破解？财政困境的产生是否有着更深层次的原因？本文以这些问题作为出发点，对政府层级改革和县级财政困境的关联性进行初步研究。本文基于全国2002—2009年的县级面板数据，采用系统GMM估计的方法，实证检验了政府层级改革中两项改革措施的影响。研究发现，财政上的省直管县以及经济管理上的强县扩权政策在政策实施当期对县级财政困境的缓解作用不是很明显；经济管理上的强县扩权的滞后一期会加剧县级财政困境；但是两项政策同时实施效果比较大；县级财政困境会随着经济发展水平的提高而得到缓解；同时，县级财政困境由于其内在的巨大惯性，使得其无法在短期内立刻得到解决。本文在实证的基础上提出破解县级财政困境的政策建议。