新疆作为我国最大的商品棉基地，棉花生产种植在新疆建设和发展中占有举足轻重的地位。划分其棉花生产优势区是指导当前棉花生产和今后实现棉花产业化、现代化生产的一项重要工作，在优势区划分基础上，研究各种气象灾害的特点和规律，进行正确的棉花生产气候灾害风险分析评估并提供适当的对策对棉花生产有着重要的意义。 本文以优势指数理论为依据，对1990、1996、2000到2004年的新疆棉花、作物统计生产资料和销售距离进行了优势区分布分析，并根据典型地区1961年到2002年的逐年初霜日期、终霜日期和逐月冰雹次数等进行气候风险分析，结果表明： (1)全疆25个县具有单产比较优势，34个县具有集中度优势，31个县具有效率优势，23个县具有规模优势，由收益指数b决定的县域综合优势区有32个。 (2)棉花综合优势区主要集中在南疆的巴音郭勒蒙古自治州、阿克苏地区、喀什地区和北疆的博乐、精河、乌苏、沙湾县和吐鲁番地区，其中库尔勒市、轮台县、尉犁县、若羌县、博乐市、精河县、阿克苏市、温宿县、库车县、阿瓦提县、沙雅县、麦盖提县、疏勒县、巴楚县、乌苏市、沙湾县显示出较高的优势指数，是新疆棉花生产收益较好的优势棉区。 (3)新疆棉区平均终霜日基本上由南向北逐渐偏晚，精河4月30日仍有10％的棉花霜害风险，因而播种期不宜太早，棉花播期愈早，遭受霜冻害和低温冷害的概率愈大；南疆棉区棉花吐絮期宜在9月30日之前，而北疆棉区更宜将棉花成熟期提前；新疆各地的无霜期有减短的趋势，其中南疆北部和西部的库车、喀什十年减少8天以上，今后新疆棉花生产的气候风险性将增大，建议新疆各棉区种植品种应突出品种早熟性；各棉区冰雹的发生具有明显的月分布不均匀性和显著的季节特征，克拉玛依每年1次，库车、喀什和巴楚等地也达到3年1至2次，这些地区有较大的受雹灾风险。