番茄叶夹角QTL的初定位

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番茄作为喜光性蔬菜作物,株型对其光合产物的生成影响尤为显著,直接关系到番茄的产量和品质。叶夹角作为番茄几何株型的重要指标,直接影响光和CO2在冠层内的分布及群体的光能利用,进而影响生长发育的过程和生理特性,最终影响产量。目前关于番茄株型的研究报道较少,对番茄叶夹角相关基因的定位更少,研究番茄叶夹角的遗传规律及定位控制叶夹角的基因,对建立分子标记辅助育种体系,改良株型,选育优良番茄品种,提高番茄品质产量等都有重要意义。番茄叶夹角为数量性状,受多基因控制,遗传规律复杂。本实验用大叶角材料‘STF’和小叶角材料‘TOM33’为亲本杂交获得F2群体(172株),进行叶夹角性状的相关分析,构建遗传连锁图谱,初步定位控制番茄叶夹角的QTL,实验结果如下:(1)通过对两亲本、F1及F2四个世代的叶夹角性状的调查数据分析可知,番茄的第4、5、6三个节位间的叶夹角不存在显著差异,叶夹角大小可用三个节位的平均值;在分离世代F2中叶夹角呈现连续变化的正态分布,说明叶夹角是典型的数量遗传性状。(2)用两个亲本对346对InDel引物筛选,获得90对多态性较好的引物,多态率为26.0%;利用F2群体构建了一张共包含15个连锁群、53个InDel标记的遗传连锁图谱,图谱总长度为143.81 cM,平均图距为2.71 cM;使用区间作图法在10号染色体上端检测到1个控制番茄叶夹角的QTL,位于标记C10M06828和C10M00490之间,与两侧标记的距离分别为10 cM和15 cM,LOD值为2.97,贡献率为10.3%;(3)对亲本材料进行全基因组重测序,根据InDel差异位点在目标QTL区域设计了44对引物,12对具有多态性,多态率为27.2%;其中6个标记被整合进连锁群,新连锁群中相应的10号染色体的长度为67.33 cM,平均图距为6.73 cM。叶夹角QTL被定位于标记C10M04385和C10M00490之间,与两侧标记的遗传距离分别是6.00 cM和5.58 cM。
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